8 个超赞的可视化工具!

你好,我是 EarlGrey,一名双语学习者,会一点编程,目前已翻译出版《Python 无师自通》、《Python 并行编程手册》等书籍。

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喜欢用 Python 做项目的小伙伴不免会遇到这种情况:做图表时,用哪种好看又实用的可视化工具包呢?

本文将介绍一些常用的 Python 可视化包,包括这些包的优缺点以及分别适用于什么样的场景。这篇文章只扩展到 2D 图,为下一次讲 3D 图和商业报表(dashboard)留了一些空间,不过这次要讲的包中,许多都可以很好地支持 3D 图和商业报表。

01 Matplotlib、Seaborn 和 Pandas

把这三个包放在一起有几个原因:首先 Seaborn 和 Pandas 是建立在 Matplotlib 之上的,当你在用 Seaborn 或 Pandas 中的 df.plot() 时,用的其实是别人用 Matplotlib 写的代码。因此,这些图在美化方面是相似的,自定义图时用的语法也都非常相似。

当提到这些可视化工具时,我想到三个词:探索(Exploratory)、数据(Data)、分析(Analysis)。这些包都很适合第一次探索数据,但要做演示时用这些包就不够了。

Matplotlib 是比较低级的库,但它所支持的自定义程度令人难以置信(所以不要简单地将其排除在演示所用的包之外!),但还有其它更适合做展示的工具。

Matplotlib 还可以选择样式(style selection),它模拟了像 ggplot2 和 xkcd 等很流行的美化工具。下面是我用 Matplotlib 及相关工具所做的示例图:

在处理篮球队薪资数据时,我想找出薪资中位数最高的团队。为了展示结果,我将每个球队的工资用颜色标成条形图,来说明球员加入哪一支球队才能获得更好的待遇。

import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

color_order = ['xkcd:cerulean', 'xkcd:ocean',
                'xkcd:black','xkcd:royal purple',
                'xkcd:royal purple', 'xkcd:navy blue',
                'xkcd:powder blue', 'xkcd:light maroon', 
                'xkcd:lightish blue','xkcd:navy']

sns.barplot(x=top10.Team,
            y=top10.Salary,
            palette=color_order).set_title('Teams with Highest Median Salary')

plt.ticklabel_format(style='sci', axis='y', scilimits=(0,0))
2874654e3e2ad12e85d7cbc695b5ea24.png

第二个图是回归实验残差的 Q-Q 图。这张图的主要目的是展示如何用尽量少的线条做出一张有用的图,当然也许它可能不那么美观。

import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.stats as stats

#model2 is a regression model
log_resid = model2.predict(X_test)-y_test
stats.probplot(log_resid, dist="norm", plot=plt)
plt.title("Normal Q-Q plot")
plt.show()
999357e3d5abc98dd80f0d0ef77a9356.png

最终证明,Matplotlib 及其相关工具的效率很高,但就演示而言它们并不是最好的工具。

02 ggplot(2)

你可能会问,「Aaron,ggplot 是 R 中最常用的可视化包,但你不是要写 Python 的包吗?」。人们已经在 Python 中实现了 ggplot2,复制了这个包从美化到语法的一切内容。

在我看过的所有材料中,它的一切都和 ggplot2 很像,但这个包的好处是它依赖于 Pandas Python 包。不过 Pandas Python 包最近弃用了一些方法,导致 Python 版本不兼容。

如果你想在 R 中用真正的 ggplot(除了依赖关系外,它们的外观、感觉以及语法都是一样的),我在另外一篇文章中对此进行过讨论。

也就是说,如果你一定要在 Python 中用 ggplot,那你就必须要安装 0.19.2 版的 Pandas,但我建议你最好不要为了使用较低级的绘图包而降低 Pandas 的版本。

ggplot2(我觉得也包括 Python 的 ggplot)举足轻重的原因是它们用「图形语法」来构建图片。基本前提是你可以实例化图,然后分别添加不同的特征;也就是说,你可以分别对标题、坐标轴、数据点以及趋势线等进行美化。

下面是 ggplot 代码的简单示例。我们先用 ggplot 实例化图,设置美化属性和数据,然后添加点、主题以及坐标轴和标题标签。

#All Salaries
ggplot(data=df, aes(x=season_start, y=salary, colour=team)) +
  geom_point() +
  theme(legend.position="none") +
  labs(title = 'Salary Over Time', x='Year', y='Salary ($)')
1a1b94ea9419ce97eb5be7cad2517b8d.jpeg
03 Bokeh

Bokeh 很美。从概念上讲,Bokeh 类似于 ggplot,它们都是用图形语法来构建图片,但 Bokeh 具备可以做出专业图形和商业报表且便于使用的界面。为了说明这一点,我根据 538 Masculinity Survey 数据集写了制作直方图的代码:

import pandas as pd
from bokeh.plotting import figure
from bokeh.io import show

# is_masc is a one-hot encoded dataframe of responses to the question:
# "Do you identify as masculine?"

#Dataframe Prep
counts = is_masc.sum()
resps = is_masc.columns

#Bokeh
p2 = figure(title='Do You View Yourself As Masculine?',
          x_axis_label='Response',
          y_axis_label='Count',
          x_range=list(resps))
p2.vbar(x=resps, top=counts, width=0.6, fill_color='red', line_color='black')
show(p2)

#Pandas
counts.plot(kind='bar')
5d4a0249d54b2b6ee86bd644304d4298.jpeg
用 Bokeh 表示调查结果

红色的条形图表示 538 个人关于「你认为自己有男子汉气概吗?」这一问题的答案。9~14 行的 Bokeh 代码构建了优雅且专业的响应计数直方图——字体大小、y 轴刻度和格式等都很合理。

我写的代码大部分都用于标记坐标轴和标题,以及为条形图添加颜色和边框。在制作美观且表现力强的图片时,我更倾向于使用 Bokeh——它已经帮我们完成了大量美化工作。

0cbdbe893079332571672bdfe7977702.png
用 Pandas 表示相同的数据

蓝色的图是上面的第 17 行代码。这两个直方图的值是一样的,但目的不同。在探索性设置中,用 Pandas 写一行代码查看数据很方便,但 Bokeh 的美化功能非常强大。

Bokeh 提供的所有便利都要在 matplotlib 中自定义,包括 x 轴标签的角度、背景线、y 轴刻度以及字体(大小、斜体、粗体)等。下图展示了一些随机趋势,其自定义程度更高:使用了图例和不同的颜色和线条。

3b447ed3388b0eb7595136e2bd042be2.jpeg
04 Plotly

Plotly 非常强大,但用它设置和创建图形都要花费大量时间,而且都不直观。在用 Plotly 忙活了大半个上午后,我几乎什么都没做出来,干脆直接去吃饭了。我只创建了不带坐标标签的条形图,以及无法删掉线条的「散点图」。Ploty 入门时有一些要注意的点:

  • 安装时要有 API 秘钥,还要注册,不是只用 pip 安装就可以;

  • Plotly 所绘制的数据和布局对象是独一无二的,但并不直观;

  • 图片布局对我来说没有用(40 行代码毫无意义!)

但它也有优点,而且设置中的所有缺点都有相应的解决方法:

  • 你可以在 Plotly 网站和 Python 环境中编辑图片;

  • 支持交互式图片和商业报表;

  • Plotly 与 Mapbox 合作,可以自定义地图;

  • 很有潜力绘制优秀图形。

以下是我针对这个包编写的代码:

#plot 1 - barplot
# **note** - the layout lines do nothing and trip no errors
data = [go.Bar(x=team_ave_df.team,
              y=team_ave_df.turnovers_per_mp)]

layout = go.Layout(

    title=go.layout.Title(
        text='Turnovers per Minute by Team',
        xref='paper',
        x=0
    ),

    xaxis=go.layout.XAxis(
        title = go.layout.xaxis.Title(
            text='Team',
            font=dict(
                    family='Courier New, monospace',
                    size=18,
                    color='#7f7f7f'
                )
        )
    ),

    yaxis=go.layout.YAxis(
        title = go.layout.yaxis.Title(
            text='Average Turnovers/Minute',
            font=dict(
                    family='Courier New, monospace',
                    size=18,
                    color='#7f7f7f'
                )
        )
    ),

    autosize=True,
    hovermode='closest')

py.iplot(figure_or_data=data, layout=layout, filename='jupyter-plot', sharing='public', fileopt='overwrite')



#plot 2 - attempt at a scatterplot
data = [go.Scatter(x=player_year.minutes_played,
                  y=player_year.salary,
                  marker=go.scatter.Marker(color='red',
                                          size=3))]

layout = go.Layout(title="test",
                xaxis=dict(title='why'),
                yaxis=dict(title='plotly'))

py.iplot(figure_or_data=data, layout=layout, filename='jupyter-plot2', sharing='public')

[Image: image.png]
30622e6450094b8bfa4630dcd1ebba3a.png
表示不同 NBA 球队每分钟平均失误数的条形图。
7beb4c96e14188f6e1b9f407dde7ebb3.jpeg
表示薪水和在 NBA 的打球时间之间关系的散点图

总体来说,开箱即用的美化工具看起来很好,但我多次尝试逐字复制文档和修改坐标轴标签时却失败了。但下面的图展示了 Plotly 的潜力,以及我为什么要在它身上花好几个小时:

ddaca10281b09f3d4e7b59453564cba7.jpeg
Plotly 页面上的一些示例图

05 Pygal

Pygal 的名气就不那么大了,和其它常用的绘图包一样,它也是用图形框架语法来构建图像的。由于绘图目标比较简单,因此这是一个相对简单的绘图包。使用 Pygal 非常简单:

  • 实例化图片;

  • 用图片目标属性格式化;

  • 用 figure.add() 将数据添加到图片中。

我在使用 Pygal 的过程中遇到的主要问题在于图片渲染。必须要用 render_to_file 选项,然后在 web 浏览器中打开文件,才能看见我刚刚构建的东西。

最终看来这是值得的,因为图片是交互式的,有令人满意而且便于自定义的美化功能。总而言之,这个包看起来不错,但在文件的创建和渲染部分比较麻烦。

29592065ce2cb695e950a41011c84db9.jpeg
06 Networkx

虽然 Networkx 是基于 matplotlib 的,但它仍是图形分析和可视化的绝佳解决方案。图形和网络不是我的专业领域,但 Networkx 可以快速简便地用图形表示网络之间的连接。以下是我针对一个简单图形构建的不同的表示,以及一些从斯坦福 SNAP 下载的代码(关于绘制小型 Facebook 网络)。

94f98c637cabe352fd64adc73a76ef0e.png

我按编号(1~10)用颜色编码了每个节点,代码如下:

options = {
    'node_color' : range(len(G)),
    'node_size' : 300,
    'width' : 1,
    'with_labels' : False,
    'cmap' : plt.cm.coolwarm
}
nx.draw(G, **options)
e6dd96a23411026b223c59934d85cf34.png

用于可视化上面提到的稀疏 Facebook 图形的代码如下:

import itertools
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

f = open('data/facebook/1684.circles', 'r')
circles = [line.split() for line in f]
f.close()

network = []
for circ in circles:
    cleaned = [int(val) for val in circ[1:]]
    network.append(cleaned)

G = nx.Graph()
for v in network:
    G.add_nodes_from(v)

edges = [itertools.combinations(net,2) for net in network]

for edge_group in edges:
    G.add_edges_from(edge_group)

options = {
    'node_color' : 'lime',
    'node_size' : 3,
    'width' : 1,
    'with_labels' : False,
}
nx.draw(G, **options)
2e45e7004521c1be4bb464b9816461cf.png

这个图形非常稀疏,Networkx 通过最大化每个集群的间隔展现了这种稀疏化。

有很多数据可视化的包,但没法说哪个是最好的。希望阅读本文后,你可以了解到在不同的情境下,该如何使用不同的美化工具和代码。

原文链接:

https://towardsdatascience.com/reviewing-python-visualization-packages-fa7fe12e622b

***

我创建了一个同名知识星球,目前会在星球内连载发布国外名家的文章和书籍,近期已更新了《埃里克叔叔谈个人成功的模型》前6章。星球和公众号内的所有翻译文章,均为个人学习使用,请勿用于商业用途。

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后面我还会陆续增加其他内容和服务,欢迎大家监督和关注。

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推荐的MySQL可视化工具有DBeaver和SQLyog。DBeaver是一个功能强大的MySQL图形化管理工具,它提供了丰富的功能,包括查询结果集合、查询分析器、服务器消息、表格数据、表格信息等,用户可以通过点击鼠标来使用这些功能。\[1\] SQLyog是另一个全面的MySQL数据库管理工具,它具有GPL许可的免费开源软件,包含了开发人员在使用MySQL时所需的大部分功能,如查询结果集合、查询分析器、服务器消息、表格数据、表格信息等,同时还可以方便地创建视图和存储过程。\[3\] 这两款工具都是非常好用的MySQL可视化工具,可以根据个人的使用习惯选择其中之一。 #### 引用[.reference_title] - *1* [13 款炫酷的 MySQL 可视化管理工具!好用到爆!!](https://blog.csdn.net/weixin_46768610/article/details/129358443)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] - *2* [11 款超赞的 MySQL 图形化工具,好用!](https://blog.csdn.net/weixin_46768610/article/details/128031166)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] - *3* [10个可视化开发的MySQL管理工具](https://blog.csdn.net/iteye_3753/article/details/82441328)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]
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