存储架构颠覆者Optane持久性内存

souy_c

已于 2022-09-14 14:01:26 修改

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分类专栏： DAOS 文章标签：分布式存储算法

于 2022-08-26 19:49:37 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/cyq6239075/article/details/126548989

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Intel中文官方命名为“英特尔傲腾持久内存”，简称为“持久内存”。英文官方名为 Intel Optane Persistent Memory，简称为 PMem，物理封装为DIMM，直接插在内存插槽上，也可以插在PCIe插槽上。他的特性就是大，快，持久性。

Intel称Optane Memory为Apache Pass(AEP)，为高性能和灵活性而设计的革命性的SCM，称Optane NVMe SSD为Clodstream。

一、基础信息

如下图所示的存储金字塔中，我们可以看到持久内存处于外存（HDD或者SSD）以及内存DRAM之间，其不论在容量、性能、价格上都是处于两者的中间位置。除此以外，在功能上，它完全就是个DRAM和外存的混合。也就是说，它即可以当做内存使用，也可以当做持久化外存设备使用，当然也可以两者兼顾，完全取决于你如何使用持久内存。

CPU通过load/store指令访问存储设备，即数据直接以cache line(64 byte)的粒度从寄存器中copy到存储设备中，或者从存储设备中copy到寄存器。而PMEM以下都是可持久化的存储设备，通过向I/O控制器发送命令，以block的粒度将数据换入换出到DRAM中，然后才能直接被CPU访问。

DRAM的容量没办法做得很大，服务器上主流的DRAM一般为16G或32G，容量再大功耗相应也会增加。而且DRAM的价格比较高，数据不能持久化。

对于SSD等一些块设备来说，确实能够满足大容量持久化的要求，但是访问延迟却是DRAM的1000多倍，同时块设备存在随机访问能力比较差的问题。虽然近些年来出现了以rocksdb/leveldb为代表的LSM-Tree结构的存储系统从一定程度上解决了块设备低效的写问题，但同时又引入了一个比较严重的写放大问题。

SSD与DRAM的访问延迟差异导致在他们之间形成了一条巨大的鸿沟，持久化内存的出现正好填补上了他们之间的差异。

IMC（integrated memory controller）与AEP之间以cache line大小的粒度传输数据，但是AEP的ECC(Error correction code) size为256字节，即AEP内部的controller与介质之间是以256字节(4个cache line)为单位进行读写。同时AEP的读写不对称，读性能明显优于写性能，所以应该避免频率的写入小对象。

AEP有两种工作模式：Memory Mode和App Direct Mode，如果细分就还有Storage Over App Direct

Memory Mode

根据AEP在存储层次结构中所处的位置，自然想到的是将DRAM作为AEP的缓存，AEP中的热数据缓存在DRAM中，这也符合计算机存储系统一惯的设计思想。在这种模式下AEP和DRAM共同组成了一块对上层透明且容量更大的易失性内存，这时系统的总容量等于AEP的容量，应用无需做任何额外的修改即可使用。DRAM到AEP的缓存算法由IMC（集成在CPU里的memory controller）硬件管理。

AppDirect Mode

应用可以不经过DRAM而直接访问AEP，用由应用自己管理，这种使用方式叫做AppDirect Mode。

为了简化持久化内存在AppDirect下的使用，Intel开发了PMDK（Persistent Memory Development Kit）。我们可以直接在PMDK的基础上去开发自己的应用，但是这些通用的库也并不一定适合所有场景。

下面这几个库用的比较多一些：
1. libpmem: 用来将数据持久化到介质上，以及提供一些优化的内存操作(memcpy, memset等)函数。
2. libpmemlog: 基于这个库可以用来写顺序追加的log等。
3. ibpmemobj: 这个库实现了一套事务机制，用来保证数据的一致性问题

二、编程模型

这个针对PMEM的编程模型叫做SNIA(storage network industry association) 细节可以参考 SNIA，介绍了用户如何来通过标准接口访问PMEM低层。

    Persistent Memory 部分中：有两种访问NVDIMMs (底层PMEM存储)的方式，第一种是pmdk，以pmem_mmap方式访问，第二种是通过pmem aware-fs来访问，这个pmem aware-fs是pmem设备支持的一种适配文件系统，可以提供标准用户访问的API(read,write,pread,pwrite…)。
    Block中操作系统抽象出 NVDIMM driver可以在其上格式化标准文件系统（xfs/ext4），对外提供文件系统API；同时也能够对外提供标准设备API 来直接访问 driver。
    第三种就是 NVME driver提供了UI ，可以通过UI直接访问NVMDIMM。

PMDK

PMDK 则是官方为 PMEM的管理员和应用开发者抽象出来的用户态接口，能够极大得简化用户操作pmem的成本。
接口架构

persistent memory development kit 接口提供了大量的编程接口，足以应对用户的各种复杂操作的需求。

对外接口以及不同的库之间关系如下：

接口概览

libpmem 提供最底层的库给应用，保证数据能够持久化。只是不保证原子性和一致性（没有事务），如果用户直接用这一个库，则需要自己保证这一些特性。

librpmem类似libpmem 提供的持久化能力以及一些问题，只是这个库支持通过RDMA访问远端的PMEM 设备。

libpmemlog 提供能够持久化的log 库

libpmemobj 用户主要是使用的库，提供了持久化、事务、内存管理、锁、基本数据结构（链表。。），保证了原子性和一致性。

libpmemblk 提供持久化的块存储，保证了块数据的原子更新和下电不丢失。

libmemkind 用作pmem的内存模式，可以通过malloc/free申请释放空间，就像使用DDR一样。

pmdk 安装

下面主要介绍的是linux 系统的安装，关于windows 的安装，可以参考https://github.com/pmem/pmdk

依赖安装：

yum install autoconf pkg-config ndctl-devel daxctl-devel pandoc -y

最新版本的pmdk 会依赖更高版本的ndctl，而这个较高版本的ndctl无法通过yum直接安装，只能通过源码编译安装。
这个过程中遇到的问题挺多的，当然看个人系统，如果系统库安装的比较全，可能也一次通过，简单记录一下。

git clone https://github.com/pmem/ndctl.git
cd ndctl
git checkout v71 # 当前的最新版本

./autogen.sh
	Activated pre-commit hook.
	GIT_VERSION = 71
	sh: aclocal: command not found
	autoreconf: aclocal failed with exit status: 127 # 执行失败
----------------------------------------------------

# 解决
sudo yum install automake libtool -y
autoreconf -ivf

# 执行成功
$ ./autogen.sh
----------------------------------------------------------------
Initialized build system. For a common configuration please run:
----------------------------------------------------------------
./configure CFLAGS='-g -O2' --prefix=/usr --sysconfdir=/etc --libdir=/usr/lib64

# 执行./configure 
./configure CFLAGS='-g -O2' --prefix=/usr --sysconfdir=/etc --libdir=/usr/lib64
...
checking for a sed that does not truncate output... (cached) /usr/bin/sed
checking for asciidoctor... missing
configure: error: asciidoctor needed to build documentation # 执行失败
----------------------------------------------------

# 解决
sudo yum install asciidoctor -y

# 重新执行 ./configure
./configure CFLAGS='-g -O2' --prefix=/usr --sysconfdir=/etc --libdir=/usr/lib64
...
checking for KMOD... no
configure: error: Package requirements (libkmod) were not met:

No package 'libkmod' found

Consider adjusting the PKG_CONFIG_PATH environment variable if you
installed software in a non-standard prefix # 执行失败
----------------------------------------------------

#解决
sudo yum install kmod kmod-devel -y

# 再次重新执行 ./configure
./configure CFLAGS='-g -O2' --prefix=/usr --sysconfdir=/etc --libdir=/usr/lib64
...
configure: error: Package requirements (uuid) were not met:

No package 'uuid' found #执行失败
----------------------------------------------------

#解决
sudo yum install libuuid-devel json-c-devel -y

# 执行./configure 成功，生成 Makefile
./configure CFLAGS='-g -O2' --prefix=/usr --sysconfdir=/etc --libdir=/usr/lib64
# 安装ndctl
make && sudo make install

编译：

# 获取代码
git clone https://github.com/pmem/pmdk
cd pmdk
git checkout stable-1.10 # 这一步也可以跳过，直接编译master分支

# 编译 ,建议以root用户来执行
make EXTRA_CFLAGS="-Wno-error" 
make install prefix=/usr/local # 如果没有root用户，可以指定自己的安装prefix，默认是/usr/local

三、PMEM性能

官方性能参考链接: https://www.intel.com/content/www/us/en/products/docs/memory-storage/optane-persistent-memory/optane-persistent-memory-200-series-brief.html

其中以128G容量为例：

写入单元为256B时，能够提供292PB 的总写入寿命，6.8GB/s的读带宽，1.85GB/s的写带宽，依次读写延时基本都在百ns量级
写入单元为64B时，寿命以及读写带宽都有下降。只能写入91PB的总数据量，读写带宽分别只有1.7Gb/s和0.45GB/s。因为PMEM的字节寻址的基本单元也是256B，也就是如果只写入64B，需要占用256B的存储空间，如果底层要写入的单元有数据，则需要先读取256B的数据单元，将64B的数据添加进去，再把256B的单元整体写入到PMEM中。这个过程会极大得降低读写性能，所以，针对PMEM的编程建议256B对齐，这样对pmem的性能更加友好。