利用JAVA多线程来提高数据处理效率

　　肿瘤大数据挖掘中经常需要处理上百亿行的文本文件，这些文件往往高达数百GB，假如文件结构简单统一，那么用sed和awk 处理是非常方便和快速的。但有时候会遇到逻辑较为复杂的处理流程，这样我一般会用JAVA来处理。但由于JAVA是单线程的，因此对于实验室多核服务器来说，能充分有效的利用起每个核会方便不少，那么这个时候就推荐用多线程来并发（并行）处理任务，从而达到运算速度倍速的提升。

　　这里举一个并行计算的例子。例子比较简单，主要是对三个数进行累加，最后输出结果。我们分别用单线程和多线程来执行，其中单线程是顺序执行而多线程则同时启动三个线程来并行（服务器CPU数大于三，所以这里是并行而不是并发）执行。

 

　　首先是单线程的运行结果：

public class Nothreading
{
    public static void main(String[] args)
    {    
        long startTime = System.currentTimeMillis();
        int sum_i = 0;
        int sum_j = 0;
        int sum_k = 0;
        for(int i = 0; i < 10000; i++)
        {    
            sum_i += 1;
　　　　　　　/* 增加程序运行时间， 后面同理 */
            for(int a = 0 ; a < 100000 ; a ++)
            {
                String s = "To cost some time";
                String[] ss = s.split(" ");
            }
        }
        for(int j = 0; j < 10000; j++)
        {    
            sum_j += 2;
            for(int a = 0 ; a < 100000 ; a ++