后缀树介绍-Suffix Tree

   前面的文章中有讲解了模式匹配相关的KMP和TrieTree，他们有各自的方式去提高性能，从而也应用在不同的场景中，这一次我们讲解后缀树（SuffixTree），相信如果没有专门去看过这些知识的同学应该很少知道后缀树，那么后缀树到底是什么，他能解决什么样的问题呢？

    后缀树（SuffixTree）一种数据结构，通过对一个字符串所有后缀操作构建一棵树，可以支持字符串的快速匹配查询，他对于以下几个字符串问题可以做到快速实现。

1>    查找字符串A是否在字符串B中，也就是常规的字符串查找问题。

2>    计算给定的字符串A在字符串B中重复出现的次数。也就是子串重复的次数。

3>    查找字符串A的最长重复子串。

4>    查找字符串A和字符串B的最长公共子串。不是LCS问题哦！

5>    查找字符串A的最长回文子串。

6>    其实SuffixTree最常用的地方是生物学的碱基配对问题.

 

     那看了上述问题，我们来讲解后缀树的结构，后缀树顾名思义是要用到字符串的后缀，先来说明下什么是后缀，比如有一个字符串dream，那么他的后缀有很多个，分别是dream它本身，ream，eam，am，m，还有一个空字符串当然也是他的后缀。他的后缀集合为：dream=suffix{dream, ream, eam, am,m,空串}。我们构建一个后缀树就要利用到这些后缀来构建一压缩的trie树，也就是Compacted Trie(将trie上单个子节点的路径进行压缩即可得到)。

      先看一个CompactedTrie的构建。假设我们的有字符串abc, abd, def我们首先用这些字符串构建一个Trie如下所示：