医学图像处理
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一颗上进的心
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三维坐标变换矩阵的推导过程
三维坐标变换矩阵的推导过程在3D计算机图形学中,我们经常需要使用多个坐标系,因此我们需要知道如何从一个坐标系转到另一个坐标系。在3D计算机图形学中,点(Point)和向量(Vector)的变换是不同的,所以需要分别讨论。1、向量的变换如图所示,有两个坐标系A、B和一个向量p。假设我们已经知道了p在坐标系A下的坐标为pA= (x,y);现在我们要求p在坐标系B下的坐标,pB= (x',y') 。也就是说,给定一个坐标系下的向量p,如何计算p在另一个坐标系下的坐标呢?显然,在坐标系...转载 2020-05-22 16:25:49 · 3804 阅读 · 0 评论 -
矩阵的坐标变换(转)
矩阵的坐标变换(转)转http://learn.gxtc.edu.cn/NCourse/jxcamcad/cadcam/Mains/main11-2.htm2.3.3 基本二维变换 基本二维变换有比例变换(Scaling)、旋转变换(Rotating)、错切变换(Shearing)和平移变换(Translating)。1)比例变换比例变换就是将平面上任意...转载 2020-04-15 17:24:20 · 4268 阅读 · 0 评论 -
dcom 和 mhd文件中的坐标系转换(11.10)
dcom 和 mhd文件中的坐标系转换(11.10)在做一些CT图像处理的时候,经常会用到dcom和mhd类型的文件。他们是CT图像的存储形式,在对这两种类型的文件进行一些3D cube截取等操作的时候经常会遇到的问题是坐标系的转化。以LUNA数据集为例(kaggle比赛中一个关于肺结节识别的项目),经常需要根据数据集中所提供的肺结节的坐标信息来定位到CT图像中该结节的真实位置。LUNA数...原创 2020-04-15 11:13:03 · 620 阅读 · 0 评论 -
pydicom和SimpleITK分别解析医学影像中dicom文件
pydicom和SimpleITK分别解析医学影像中dicom文件首先,无论是pydicom还是SimpleITK都是需要事先导入到python中的库,如果使用的是pycharm IDE,可以先创建python3的虚拟环境,然后在虚拟环境下通过file-setting-Project interpreter ,在添加模块里面直接搜上述两个库的名称,点击安装即可。pydicom提取...转载 2020-04-15 14:49:00 · 2309 阅读 · 1 评论 -
VTK图像处理之vtkImageReslice
VTK图像处理之vtkImageReslice vtk类之vtkImageReslice:基本算法,对体数据沿着轴进行切片 VTK/Tutorials/Extents 三维图像切面提取切片(Slice)或切面是三维图像比较常用的概念,尤其在医学图像中。通过提取切面可以方便地浏览和分析图像内部组织结构。VTK中vtkImageReSlice类可以实现图像切面的提取...原创 2020-03-24 10:52:13 · 5556 阅读 · 0 评论 -
Python-----SimpleITK学习
SimpleITK学习(一)基本概念SimpleITK学习(二)图像读取[医学图像处理] Python SimpleITK软件包常用参数与使用方法分析Python中利用SimpleITK读取DICOM文件原创 2020-03-23 18:27:59 · 930 阅读 · 2 评论 -
Python----NIFTI操作.nii文件
python读写.nii格式图像The NIFTI file format用pytorch处理医学图像(以nifity图像为例)----持续更新中nibabel.Nifti1Image()的Example原创 2020-03-23 18:27:17 · 1496 阅读 · 0 评论 -
DICOM的常用Tag分类和说明、DICOM文件坐标信息整理和转换
DICOM文件坐标信息整理和转换DICOM的常用Tag分类和说明dicom文件tag详解医学图像之DICOM格式解析DICOM3.0影像文件中的平面和立体坐标信息python 读取DICOM头文件的实例dicom文件tag详解Dicom全称是医学数字图像与通讯,这里讲diocm格式文件的tag标记做详细解读。dicom中文协议文档:ht...原创 2020-03-23 18:10:46 · 2273 阅读 · 0 评论 -
pydicom----用法一
pydicom-易学教程 DICOM “.dcm”数据基本操作方法(python) pydicom的官方documents参考 https://pydicom.github.io/pydicom/stable/getting_started.html Python对DICOM图像进行阈值分割 1、dicom.dcmread()def dc...原创 2020-03-23 18:01:49 · 2288 阅读 · 0 评论