nnunetv2系列:解压zip文件到nnunet默认路径

nnunetv2系列: 解压zip文件到nnunet默认路径

这个命令的功能是将zip文件解压到nnUNet_results路径下的指定位置，用于后续推理使用。在新的电脑上面使用同样需要安装nnUNet库以及配置环境。
根据nnUNetv2_install_pretrained_model_from_zip命令在pyproject.toml文件中查找到nnUNetv2_install_pretrained_model_from_zip = "nnunetv2.model_sharing.entry_points:install_from_zip_entry_point"信息，那么在nnunetv2.model_sharing.entry_points.py文件中可以看到install_from_zip_entry_point定义的相关的参数和默认值。
我们也可以通过命令nnUNetv2_install_pretrained_model_from_zip -h直接获取相关的参数信息。

查看相关参数说明

nnUNetv2_install_pretrained_model_from_zip -h
# usage: nnUNetv2_install_pretrained_model_from_zip [-h] zip

# Use this to install a zip file containing a pretrained model.

# positional arguments:
# zip         zip file

# options:
# -h, --help  show this help message and exit

终端执行代码

nnUNetv2_install_pretrained_model_from_zip \
/home/xxx/nnUNet/nnUNet_results/xxx/export_model.zip

关键代码

import zipfile

from nnunetv2.paths import nnUNet_results


def install_model_from_zip_file(zip_file: str):
    with zipfile.ZipFile(zip_file, "r") as zip_ref:
        zip_ref.extractall(nnUNet_results)