综合判别改善指数 IDI

本文摘自:两个预测模型比较,再教你一招IDI

之前的博客中介绍了AUC(曲线下面积)和NRI(净重分类改善指数)两个指标来评估模型的Discrimination能力,实际上NRI还有个孪生兄弟——IDI(Integrated Discrimination Improvement,综合判别改善指数)。

IDI是由Pencina等人于2008年提出的,应该说算是一个非常新的判别指标了。由于它考虑了不同切点的情况,可以用来反映模型的整体改善状况,在一定程度上补齐了NRI的短板。同时,虽然AUC也考虑到了不同切点,但是AUC的改善情况在临床中不易解释,IDI也因此弥补了AUC的缺陷,可以形象地展示研究对象被准确重新判别的比例。

在进行2个疾病模型比较,或者2个指标诊断效能比较时,除了传统的ROC曲线及其AUC,也可以同时给出NRI和IDI,更加全面多层次的展示模型的改善情况。

IDI的计算其实也比较简单,它反映的是两个模型预测概率差距上的变化,因此是基于疾病模型对每个个体的预测概率计算所得。它的计算方法为:

IDI= (Pnew,events - Pold,events) - (Pnew,non-events - Pold,non-events)

其中Pnew,events、Pold,events表示在患者组中,新模型和旧模型对于每个个体预测疾病发生概率的平均值,两者相减表示预测概率提高的变化量,对于患者来说,预测患病的概率越高,模型越准确,因此差值越大则提示新模型越好。

而Pnew,non-events、Pold,non-events表示在非患者组中,新模型和旧模型对于每个个体预测疾病发生概率的平均值,两者相减表示预测概率减少的量,对于非患者来说,预测患病的概率越低,模型越准确,因此差值越小则提示新模型越好。

最后,将两部分相减即可得到IDI,总体来说IDI越大,则提示新模型预测能力越好。与NRI类似,若IDI>0,则为正改善,说明新模型比旧模型的预测能力有所改善,若IDI<0,则为负改善,新模型预测能力下降,若IDI=0,则认为新模型没有改善。

我们可以通过计算Z统计量,来判断IDI与0相比是否具有统计学显著性,统计量Z近似服从正态分布,公式如下:

Z=\frac{IDI}{\sqrt{(SE_{events})^2+(SE_{non-events})^2}}

其中SEevents为Pnew,events- Pold,events的标准误,首先在患者组,计算新、旧模型对每个个体的预测概率,求得概率的差值,再计算差值的标准误即可。

同理,SEnon-events为Pnew,non-events- Pold,non-events的标准误,是在非患者组,计算新、旧模型对每个个体的预测概率,求得概率的差值,再计算差值的标准误即可。

 

关于IDI,还可参考这篇博客:综合判别改善指数IDI的计算方法(含二分类和生存资料IDI计算的R代码)

关于IDI的计算工具包,如下所示:

包的名称下载地址分类资料结局生存资料结局
PredictABELCRANreclassification函数不支持
survIDINRICRAN不支持IDI.INF函数

 

总结

已经介绍了AUC、NRI和IDI这3个指标在判断和比较两个疾病风险模型预测能力中的应用,三者相辅相成,各有不同,最后我们再来总结几点需要注意的地方。

1. 相对于经典的AUC指标来说,NRI和IDI属于较为新颖的指标,还处于初步发展的阶段,虽然近年来受到越来越多研究者的关注,但是AUC的提高依然还是可以作为模型预测能力改善的第一判断标准。当然,如果能够同时给出NRI和IDI,则更是锦上添花,在理想的情况下,三者得到的结论应该是较为一致的。

2. NRI的计算与设定的切点密切相关,预测概率的等级划分应该选择适宜的界值。如果等级划分过宽,NRI计算值可能就会比较小,而达不到统计学显著性,如果等级划分过窄过细,则会得到更为精细的NRI,但是却失去了临床实践的指导意义。因此,预测概率切点的划分对于计算NRI来说显得十分重要,一定要结合临床专业的需求来确定。

3. 如果目前还无法确定明确的划分切点,那么IDI和AUC可能是较好的选择,如果比较关心切点处的改善情况,那么NRI可能是较好的选择。如果结局指标不是二分类变量,而是多分类情况,例如高、中、低风险,那么NRI和IDI可能是更好的选择,AUC则显得较为复杂。

4. 同时,我们还要考虑到临床的可行性和经济效益问题,例如,如果在不损失特异度的情况下,新增加一个预测指标,不会带来太多额外的经济负担,即使提高模型的预测能力并不是太显著,也可以考虑将新指标加入到预测模型中。相反,如果一个新指标难以获取,或者检测费用昂贵,即使模型的预测能力有所改善,可能也要保守选择传统的、成本较低的预测模型。

 

参考资料:两个预测模型比较,再教你一招IDI

参考文献:

Evaluating the added predictive ability of a new marker: From area under the ROC curve to reclassification and beyond

 

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