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原创 Shiny server: application failed to start
shiny server 已经正确安装,并且APP需要的相关的包也已经正确安装,但是却依旧出现application failed to start查找问题:通过查看shiny server的log来检查问题。权限原因。解决办法:1、修改配置文件:sudo vim /etc/shiny-server/shiny-server.conf修改run_as shiny为...
2019-04-07 20:17:20
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原创 Ubuntu 16.04 安装最新的R版本 (R 3.5.2)
Ubuntu 16.04 默认安装的是R 3.2 ,如需要安装最新的R,需要更新软件源。方法:1、卸载原来的R 3.2 sudo apt-get autoremove r-base-core2、添加最新的镜像地址将deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/添加到 /etc/apt/s...
2019-02-22 14:56:05
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原创 Rshiny: error "reticulate is in use, but python was not specified".
在把app部署到shiny官网的云端上时,出现错误:"reticulate is in use, but python was not specified".描述:这个问题在GitHub的rsconnect上已经有讨论。传送门:https://github.com/rstudio/rsconnect/issues/330这个问题是app中的包依赖了reticulate这个包,可以通过命...
2019-02-20 15:54:56
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原创 Ubuntu apt-get update 错误:忽略和404
Ubuntu的update错误,报404和忽略的错误。原因是很多源不能使用或失效。在【系统设置】—【软件更新】中将【其他软件】的√取消之后在【Ubuntu软件】中点击【下载自】选择【其他站点】,在选择下载服务器中点击【选择最佳服务器】,之后等待测试下载服务器...等待完毕,系统会自动选择一个站点服务器,选择确定后,服务器站点会添加到下载自。之后点击【关闭】-【重新载入】...
2018-09-22 20:47:19
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原创 服务端更新图片之后,在前端显示图片不更新
在服务端的图片更新之后,前端的图片没有更新?这是因为浏览器首次读取服务端的图片之后,再次读取同名图片,会直接从临时文件中读取,不再请求服务端。如果清除浏览器缓存,则图片更新。可以修改图片名,或者给图片加上版本号。var version = Math.random();<img src="./test.png?"+version /> ...
2018-09-03 22:12:07
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原创 Mybatis分页插件PageHelper自动添加limit
今天遇到了在mybatis中写limit报错的问题查看服务发现在sql中自动添加了limit,而我之前已经在sql中去除limit了。查阅资料知道使用Mybatis分页插件PageHelper会自动添加limit,与自己手动在sql中添加的limit重复了。...
2018-08-08 13:29:02
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原创 Ubuntu网络异常,火狐打不开
现象:Ubuntu网络异常,ping不通类似百度等网址,连接的wifi正常,火狐浏览器打不开解决办法:1、修改DNS域名解析的配置文件(/etc/resolv.conf ),不能解析的都添加#注释sudo vi /etc/resolv.conf //打开文件nameserver 114.114.114.114 //在resolv.conf中添加sudo service...
2018-08-03 13:47:23
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原创 org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: 报错
org.springframework.beans.factory.BeanCreationException: Error creating bean with name 'marketController': Injection of autowired dependencies failed; nested exception is org.springframework.beans.fac...
2018-07-13 16:28:02
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原创 eclipse错误:Missing artifact com.github.pagehelper:pagehelper:jar:3.4.2
父工程的pom.xml中已有pagehelper的版本号,但是eclipse无法下载下来,依赖的Maven库中没有原来的 <dependency> <groupId>com.github.pagehelper</groupId> <artifactId>pagehelper</art...
2018-06-27 00:04:02
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转载 ubuntu进程管理方法
文章转载自:http://www.cnblogs.com/xinzaibing/archive/2012/03/24/2415434.htmlubuntu进程管理方法ps 显示当前进程ps -l 显示详细信息 ps -u 以用户的格式显示 相关字段说明F 进程状态标志 S 进程状态代码 UID 进程执行者ID PPID 父进程标识(parent proc
2017-06-25 01:15:11
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转载 生物信息学习——cufflinks
原文地址:http://blog.sina.com.cn/s/blog_751bd9440102v72b.htmlCufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等几支主要的程序。主要用于基因表达量的计算和差异表达基因的寻找。一. 简介Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等几支主要的程序。主要用于基因表达量的计算和差异表达基因的寻找。二. 安装Cufflin
2017-03-06 15:45:03
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原创 生物信息学习——tophat运行报错
在装好tophat之后,配置好环境变量,下载官网上的test_data文件,进入test_data文件目录,运行tophat,结果报错:$ tophat -r 20 test_ref reads_1.fq reads_2.fq[2017-03-02 14:48:43] Beginning TopHat run (v2.1.1)---------------------------
2017-03-02 13:29:36
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原创 生物信息学习——bowtie实例解析
-a——保留bowtie 报告所有有效的比对(服从比对策略:-v 2).在这种情况下,bowtie在大肠杆菌基因组中发现5个不准确匹配;1个hit(列出的第二个)有1个配错数,而其他4个hit有2个配错数。 四个在反向参考链上,一个在正向链上。 注意,它们没有按照从最好到最差的顺序列出。[注意:如果不加-a则只显示一个结果(上面结果的第一列)]-v——两种模式之一(另一种模式是-n),
2017-03-01 14:40:00
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翻译 生物信息学习——bowtie2使用手册
用法bowtie2 [options]* -x {-1 -2 | -U } -S []主要参数-x 参考基因组(reference genome)通过bowtie2-build指令在Index文件中的索引文件的前缀,此前缀不包含索引文件的 .1.bt2 / .rev.1.bt2 / etc. bowtie2 等。首先实在当前目录中搜索(即在当前目录
2017-02-28 14:49:32
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转载 ubuntu学习—— ls-l 详解
转自http://blog.csdn.net/sjzs5590/article/details/8254527以root的家目录为例:可以看到,用ls -l命令查看某一个目录会得到一个7个字段的列表。第1行:总计(total)Total后面的数字是指当前目录下所有文件所占用的空间总和。可以使用ls –lh查看,也可使用ls –alh查看。第1字段: 文件属性字段-rw-r–r– 1 root
2017-02-27 14:05:09
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空空如也
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