alchemy

alchemy工具的使用:
A:在ubuntu台式机上安装alchemy。官网alchemy有bug,在guihub上下载开源改良版进行配置,github网址: http://www.lai18.com/content/5210104.html,安装教程参见github上的readme
B:alchemy官网( http://alchemy.cs.washington.edu/)上有案例程序,跑了官网上的protein案例,训练时花费13小时完成,做推断的时候,会崩:killed。需要查看原因。
C:alchemy训练数据集和推理的具体教程: http://wiki.ict.usc.edu/cogarch/images/3/3e/Manual.pdf英文原版
http://www.cnblogs.com/heshizhu/archive/2012/11/12/2766230.html中文译文
D:跑得官网上吸烟案例程序截图:
训练../bin/learnwts -d -i smoking.mln -o smokingresult.mln -t train.db (-b表示判别式学习)
推断../bin/infer -i smokingresult.mln -e test.db -r smoker.results -q Cancer;Smoker;Friends -mc -maxSteps 20000
-maxSteps用于指定算法最大迭代次数,当前的系统可以执行四种概率推理算法:(Lifted) Belief Propagation (-bp), MC-SAT(-ms), Gibbs抽样(-p)和模拟退火(-simtp)
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