2013年04月_morningCV

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原创 Phylip进化树的使用，偏重于文件格式的获取

Phylip进化树的使用，偏重于文件格式的获取Table of Contents1 关于这个软件2 mix.exe格式3 pars.exe4 附录：phylip软件子程序说明1 关于这个软件这个软件包含的内容很多，里面有许多的程序。后面我会附上我从别处看到的一个总结，这里我们只是侧重于，对于这些程序所需要的输入文件的格式进行说明，并讨论具体的实现方法

2013-04-30 13:51:28 8343

原创 GenomePixelizer使用总结

Table of Contents1 神灯软件的使用总结（GenomePixelizer)1.1 运行所需要的文件1.2 输入文件的格式1.3 图片的生成1.4 总结，现在暂时使用的是这些，以后有其他的用处再进行补充。1 神灯软件的使用总结（GenomePixelizer)这是一款生物分析类型的软件。从开始到现在我使用到功能只有其中的一个功能，也就

2013-04-29 22:43:41 2716

转载 perl printf函数的使用

printf函数可以格式化输出字符串用法：printf FILEHANDLE FORMAT, LISTprintf FORMAT, LIST例如：printf函数先格式化字符串再输出到指定文件或当前缺省文件中，如： printf OUTFILE (“You owe me %8.2f", $owing);此语句取出变量$owing的值并替换掉串中的%8.2f，%8.2

2013-04-29 13:34:06 3267

原创 TeXmacs对中文的支持

折腾了n天的latex，实在没有解决，只能转战texmacs了，这里涉及到对中文的支持问题。第一，下载中文字体，输入中文的地方需要设置格式如果全文是中文文档，可以选择菜单栏：Document->Language->Chinese 如果是部分文本需要设为中文，选择菜单栏：Format->Language->Chinese （也许不需要设置语言？例如，最近版本, v1.0.

2013-04-28 06:00:07 8131 2

转载 Latex 中文支持CJK的安装与配置

Latex中文支持CJK的安装与配置在这里记一下自己Latex中文安装与配置的方法,为还没有搞定这个问题的朋友们提供一点小小的帮助.CJK的安装包可以从这里下载得到:http://www.cjk.org我们还可以从王垠的个人主页下载一个方便安装的程序:http://learn.tsinghua.edu.cn/homepage/2001315450/tex_frame.html

2013-04-23 20:08:42 9043

转载 fedora 10 下LaTeX-CJK和中文字体的安装 2/2

http://blog.sina.com.cn/s/blog_4d181eef0100boyw.html新买了电脑，安装的是Fedora 10。装完之后发现系统没有安装CJK，所以无法使用中文LaTeX。这也不意外，至少以前别的发行版本也几乎不会预装好CJK，反正安装CJK自身也不困难。Fedora 10使用的是Texlive而不是tetex，由于系统自身定制的Texlive不

2013-04-22 19:15:20 1770

原创 linux下的dc计算器

dc采用逆波兰式计算表达式，计算过程是对栈的手动维护。逆波兰式看起来很别扭，但跑起来当然是很有效率的。乱七八糟的东西就不说了，直接切入script正题负号在dc里用_表示而非-，因为-是二元运算符“减号”打印类命令：p ：打印栈顶元素并换行n : 打印栈顶元素并将其弹出栈，完毕后不换行P :

2013-04-15 21:21:48 2709

原创酵母端粒位置信息

TEL01L 1 801TEL01R 229411 230218TEL02L 1 6608TEL02R 812379 813184TEL03L 1 1098TEL03R 315783 316620TEL04L 1 904TEL04R 1524625 1531933TEL05L 1 6473TEL05R 569599 576874TEL06L 1 5530

2013-04-15 19:46:42 1955

转载我使用过的Linux命令之dos2unix - 将DOS格式文本文件转换成UNIX格式

我使用过的Linux命令之dos2unix - 将DOS格式文本文件转换成UNIX格式本文链接：http://codingstandards.iteye.com/blog/810900 （转载请注明出处）^J = = \n^M = = \r用途说明dos2unix命令用来将DOS格式的文本文件转换成UNIX格式的（DOS/MAC to U

2013-04-15 18:41:40 1159

转载 fedora 18 问题汇总，包括konsole光标的漂移

http://www.cnblogs.com/lvzaina/articles/2828373.html安装我下载的镜像为 Fedora-17-x86_64-Live-KDE.iso，利用 Universal USB Installer 软件进行U盘安装。中文支持应用程序 - 管理 - 语言里选择「Chinese(P.R.China) - 中文(简体)」，系统会自

2013-04-10 18:51:21 2432

原创 perl横竖转换

#system 'cat 11.csv | perl -nale 'for (0 .. $#F) { $r[$_] .= $F[$_] . " " }; END { print for @r }' > 11.txt';#system 'cat 12.csv | perl -nale 'for (0 .. $#F) { $r[$_] .= $F[$_] . " " }; END { print

2013-04-09 17:08:39 1299

转载 KDE中文

安装Fedora 15后，默认KDE无法显示中文，但可以用yum list这个命令可以搜索安装关于中文汉化的程序：步骤：yum list kde*chinese可以找到下列两个文件，kde-i18n-Chinese.noarch kde-l10n-Chinese.noarch 只安装第二个：#yum insta

2013-04-08 13:41:18 1264

输入中文的地方需要设置格式如果全文是中文文档，可以选择菜单栏：Document->Language->Chinese 如果是部分文本需要设为中文，选择菜单栏：Format->Language->Chinese （也许不需要设置语言？例如，最近版本, v1.0.7.19 在Ubuntu 12.10上，只要直接设置 Format -> Name -> CJK -> MicroHei 即可。） Trouble shooting：官方的texmacs源版本依然比较旧，支持中文输入会有问题而在Ubuntu上和Archlinux上的经验来看，最新的版本 v1.0.7.17 是没有问题的（v1.0.7.16都会存在问题）。而最新的版本需要源代码编译安装（可以在gitorious下载最新的.tar.gz包并解压缩）。如果你看到的Chinese菜单项处于灰色不可用状态，说明没有安装TeXmacs没有找到合适的字体。简单的解决办法是，下载fireflysung字体： http://www.study-area.org/apt/firefly-font/fireflysung-1.3.0.tar.gz 解压缩后，将其中的.ttf文件复制到 ~/.TeXmacs/fonts/truetype 目录下之后命令行执行 texmacs --delete-font-cache 再次打开TeXmacs后，就应该看到菜单项已变为可用。

2013-04-28

空空如也

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