nf-core/fetchngs 项目使用教程
1. 项目的目录结构及介绍
nf-core/fetchngs/
├── conf/
│ ├── base.config
│ ├── custom.config
│ └── test.config
├── docs/
│ ├── CITATIONS.md
│ ├── output.md
│ └── usage.md
├── workflows/
│ ├── main.nf
│ └── nextflow.config
├── .github/
│ ├── ISSUE_TEMPLATE/
│ └── workflows/
├── .gitignore
├── CODE_OF_CONDUCT.md
├── LICENSE
├── README.md
├── nextflow.config
└── pyproject.toml
- conf/: 包含项目的配置文件,如
base.config
,custom.config
,test.config
等。 - docs/: 包含项目的文档文件,如
CITATIONS.md
,output.md
,usage.md
等。 - workflows/: 包含项目的主要工作流文件
main.nf
和nextflow.config
。 - .github/: 包含 GitHub 相关的配置文件和模板。
- .gitignore: Git 忽略文件。
- CODE_OF_CONDUCT.md: 项目的行为准则。
- LICENSE: 项目的许可证。
- README.md: 项目的介绍和使用说明。
- nextflow.config: Nextflow 的主配置文件。
- pyproject.toml: Python 项目的配置文件。
2. 项目的启动文件介绍
项目的启动文件是 workflows/main.nf
。这个文件是 Nextflow 工作流的主入口,包含了项目的核心逻辑和流程定义。
3. 项目的配置文件介绍
- nextflow.config: 这是 Nextflow 的主配置文件,包含了项目的全局配置,如参数定义、流程配置、资源配置等。
- conf/base.config: 基础配置文件,定义了项目的基本配置参数。
- conf/custom.config: 自定义配置文件,用户可以根据需要修改此文件以适应特定的运行环境。
- conf/test.config: 测试配置文件,用于测试环境下的配置参数。
以上是 nf-core/fetchngs
项目的基本使用教程,涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用该项目。