Leidenalg 开源项目教程

Leidenalg 开源项目教程

leidenalgImplementation of the Leiden algorithm for various quality functions to be used with igraph in Python.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/le/leidenalg

1. 项目的目录结构及介绍

Leidenalg 项目的目录结构如下：

leidenalg/
├── leidenalg/
│   ├── __init__.py
│   ├── community_leiden.py
│   ├── vertex_partition.py
│   ├── utils.py
│   └── ...
├── tests/
│   ├── test_leiden.py
│   └── ...
├── setup.py
├── README.md
├── LICENSE
└── ...

目录结构介绍

• leidenalg/: 包含项目的主要代码文件。
  • __init__.py: 初始化文件，使得目录可以作为 Python 包导入。
  • community_leiden.py: 实现 Leiden 算法的核心功能。
  • vertex_partition.py: 定义顶点分区的类和方法。
  • utils.py: 包含一些实用工具函数。
• tests/: 包含项目的测试文件。
  • test_leiden.py: 针对 Leiden 算法的测试用例。
• setup.py: 用于安装项目的配置文件。
• README.md: 项目说明文档。
• LICENSE: 项目许可证文件。

2. 项目的启动文件介绍

Leidenalg 项目的启动文件主要是 community_leiden.py，该文件包含了 Leiden 算法的核心实现。以下是该文件的主要内容：

# community_leiden.py

import igraph as ig
from .vertex_partition import ModularityVertexPartition

def find_partition(graph, partition_type=ModularityVertexPartition, **kwargs):
    # 实现 Leiden 算法的主要逻辑
    ...

if __name__ == "__main__":
    # 示例代码，用于测试 Leiden 算法
    G = ig.Graph.Erdos_Renyi(100, 0.1)
    part = find_partition(G, ModularityVertexPartition)
    print(part)

启动文件介绍

• find_partition 函数：实现 Leiden 算法的主要逻辑，接受图对象和分区类型作为参数。
• if __name__ == "__main__": 部分：包含一个示例代码，用于测试 Leiden 算法。

3. 项目的配置文件介绍

Leidenalg 项目的配置文件主要是 setup.py，该文件用于安装和配置项目。以下是该文件的主要内容：

# setup.py

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name='leidenalg',
    version='1.1.3',
    description='An R interface to the Leiden algorithm for community detection',
    long_description=open('README.md').read(),
    long_description_content_type='text/markdown',
    author='V.A. Traag',
    author_email='vtraag@gmail.com',
    url='https://github.com/vtraag/leidenalg',
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        'igraph',
        'Rcpp',
        'RcppArmadillo',
        'RcppEigen'
    ],
    classifiers=[
        'Development Status :: 5 - Production/Stable',
        'Intended Audience :: Science/Research',
        'License :: OSI Approved :: GNU General Public License v3 (GPLv3)',
        'Programming Language :: Python :: 3',
        'Programming Language :: Python :: 3.6',
        'Programming Language :: Python :: 3.7',
        'Programming Language :: Python :: 3.8',
        'Programming Language :: Python :: 3.9',
    ],
    license='GPL-3',
    keywords='community detection, graph, network, Leiden algorithm',
    project_urls={
        'Source': 'https://github.com/vtraag/leidenalg',
        'Tracker': 'https://github.com/vtraag/leidenalg/issues',
    },
)

配置文件介绍

• setup 函数：用于配置项目的名称、版本、描述、依赖项等信息。
• install_requires 列表：列出了项目运行所需的依赖项。
• classifiers 列表：提供了项目的分类信息，帮助用户了解项目的适用范围和状态。

以上是 Leidenalg 开源项目的教程，

leidenalgImplementation of the Leiden algorithm for various quality functions to be used with igraph in Python.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/le/leidenalg