MinD-Vis 项目使用教程

MinD-Vis 项目使用教程

mind-vis Code base for MinD-Vis 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mi/mind-vis

1. 项目介绍

MinD-Vis 是一个用于从脑部记录中解码人类视觉刺激的框架。该项目旨在通过脑电图（fMRI）数据重建视觉图像，从而加深对人类视觉系统的理解，并为脑机接口（BCI）技术奠定基础。MinD-Vis 的核心技术包括稀疏掩码脑建模（SC-MBM）和双重条件潜在扩散模型（DC-LDM），能够在极少数据标注的情况下生成具有高度细节和语义意义的图像。

2. 项目快速启动

2.1 环境准备

首先，确保你已经安装了 Conda 环境管理工具。然后，创建并激活名为 mind-vis 的 Conda 环境：

conda env create -f env.yaml
conda activate mind-vis

2.2 下载数据和预训练模型

由于数据和预训练模型较大，需要从 FigShare 下载并解压到项目根目录：

# 下载数据
wget https://figshare.com/your-data-link -O data.zip
unzip data.zip -d /path/to/mind-vis/data

# 下载预训练模型
wget https://figshare.com/your-pretrain-link -O pretrains.zip
unzip pretrains.zip -d /path/to/mind-vis/pretrains

2.3 运行预训练

在准备好环境和数据后，可以开始进行 fMRI 数据的预训练：

python code/stageA1_mbm_pretrain.py

2.4 微调模型

预训练完成后，使用测试集数据对模型进行微调：

python code/stageA2_mbm_finetune.py --dataset GOD --pretrain_mbm_path results/fmri_pretrain/RUN_FOLDER_NAME/checkpoints/checkpoint.pth

2.5 生成图像

最后，使用微调后的模型生成解码图像：

python code/gen_eval.py --dataset GOD

3. 应用案例和最佳实践

3.1 应用案例

MinD-Vis 可以应用于多个领域，包括但不限于：

• 神经科学研究：通过解码 fMRI 数据，研究人员可以更好地理解人类视觉系统的运作机制。
• 脑机接口：为脑机接口技术提供基础，实现通过脑电信号控制外部设备。
• 医学诊断：帮助医生通过脑部活动图像诊断和治疗相关疾病。

3.2 最佳实践

• 数据预处理：确保 fMRI 数据的预处理步骤正确，以提高模型的解码精度。
• 模型调优：根据具体应用场景调整模型参数，以获得最佳的解码效果。
• 多GPU训练：使用多GPU并行训练可以显著提高训练速度。

4. 典型生态项目

MinD-Vis 作为一个开源项目，可以与其他相关项目结合使用，形成更强大的生态系统：

• DeepMind：结合 DeepMind 的深度学习技术，进一步提升模型的解码能力。
• OpenNeuro：使用 OpenNeuro 平台上的公开 fMRI 数据集进行训练和验证。
• NeuroDecodeR：与 NeuroDecodeR 项目结合，实现更高效的脑电信号解码。

通过这些生态项目的结合，MinD-Vis 可以在更多领域发挥其强大的解码能力，推动相关技术的发展。

mind-vis Code base for MinD-Vis 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mi/mind-vis