推荐：CBIM-Medical-Image-Segmentation — 深度学习医疗影像分割框架-CSDN博客

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推荐：CBIM-Medical-Image-Segmentation — 深度学习医疗影像分割框架

CBIM-Medical-Image-SegmentationA PyTorch framework for medical image segmentation项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/cb/CBIM-Medical-Image-Segmentation

项目介绍

在医疗领域，准确的图像分割是疾病诊断和治疗规划的关键。CBIM-Medical-Image-Segmentation 是一个基于 PyTorch 的开放源代码框架，致力于为学术研究者提供一个简单易用的平台，以开发和评估深度学习模型。该框架支持多种卷积神经网络（CNN）和变换器模型，并对多个医学图像数据集进行公平的评价与对比。

项目技术分析

CBIM-Medical-Image-Segmentation 集成了最新的技术和优化策略，如：

支持 PyTorch 2.0，提供了新的教程。
利用 GPU 进行数据增强，加速训练过程。
更新了 MedFormer 研究的修订版本，包括更多实验和分析。
添加了对新数据集的支持，如 AMOS22 和 KiTS19。
实现了 PyTorch 的分布式数据并行（DDP）和自动混合精度（AMP）训练。

此外，项目还涵盖了模型定义、配置、训练和评估的全过程，支持 2D、3D 数据、多模态以及多种任务的模型、损失函数、指标和增广方法。

项目及技术应用场景

医学研究：研究人员可以利用此框架快速实现和比较不同的深度学习模型，推动医学图像分割的进步。
教育培训：教学中可作为实例，帮助学生理解深度学习在医疗影像处理的应用。
临床实践：医院和诊所可以借此评估新技术的效果，提升诊断效率和准确性。

项目特点

全面性：涵盖从数据预处理到模型评估的全套流程，并提供多种 SOTA 模型作为基准。
易用性：模型定义、训练和评估代码简洁明了，无复杂的封装。
多样性：支持 2D、3D、多模态和多任务的模型，包括但不限于 MedFormer、UNet 及其变体、Transformer 基于的模型等。
灵活性：不仅可以直接在其他框架中使用提供的模型，还能通过自定义配置文件轻松调整训练参数。
持续更新：持续添加新模型和数据集，保持与时俱进。

支持模型一览

MedFormer
UNet（不同构建块）
UNet++
Attention UNet
Dual Attention
TransUNet
SwinUNet
UNETR
VT-UNet
nnFormer
SwinUNETR
更多模型即将推出...

引用

如果您发现本项目有所帮助，请引用以下相关论文：

@inproceedings{gao2021utnet,
  title={UTNet: a hybrid transformer architecture for medical image segmentation},
  author={Gao, Yunhe and Zhou, Mu and Metaxas, Dimitris N},
  booktitle={International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention},
  pages={61--71},
  year={2021},
  organization={Springer}
}

@article{gao2022data,
  title={A data-scalable transformer for medical image segmentation: architecture, model efficiency, and benchmark},
  author={Gao, Yunhe and Zhou, Mu and Liu, Di and Yan, Zhennan and Zhang, Shaoting and Metaxas, Dimitris N},
  journal={arXiv preprint arXiv:2203.00131},
  year={2022}
}

CBIM-Medical-Image-Segmentation 提供了一个强大且灵活的工具箱，无论你是科研新手还是经验丰富的开发者，都能从中受益。立即加入，探索医疗影像分割的无限可能！

CBIM-Medical-Image-SegmentationA PyTorch framework for medical image segmentation项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/cb/CBIM-Medical-Image-Segmentation