PUREPLES 开源项目教程
1. 项目介绍
PUREPLES 是一个专注于神经进化的纯 Python 库,依赖于 neat-python 实现。该项目包含了 HyperNEAT 和 ES-HyperNEAT 的实现。HyperNEAT 是一种利用 NEAT 技术进化大规模神经网络的方法,而 ES-HyperNEAT 则是在 HyperNEAT 的基础上,允许进化过程中使用的基底(substrate)能够进化,从而减少用户的初始工作量,并通常创建更合适的基底。
2. 项目快速启动
安装指南
首先,确保你已经安装了以下依赖项:
- numpy
- neat-python
- graphviz
- matplotlib
- gym
你可以使用 pip
安装这些依赖项:
pip install numpy neat-python graphviz matplotlib gym
接下来,下载 PUREPLES 的源代码并运行安装脚本:
git clone https://github.com/ukuleleplayer/pureples.git
cd pureples
pip install .
实验设置
HyperNEAT 实验
- 定义基底:创建一个包含输入节点和输出节点的列表,以及一个包含隐藏节点的列表(每个列表代表一层)。
- 配置文件:创建一个配置文件,定义 NEAT 特定的参数。
- 适应度函数:定义一个适应度函数,设置每个基因组的适应度。
- 创建种群:使用配置文件创建一个种群。
- 运行种群:使用适应度函数和配置文件运行种群。
示例代码:
from pureples.hyperneat import create_phenotype_network
# 定义基底
input_nodes = [(0, 0), (1, 1)]
output_nodes = [(2, 2)]
hidden_nodes = [[(1, 0)], [(1, 2)]]
# 创建配置文件
config = neat.Config(neat.DefaultGenome, neat.DefaultReproduction,
neat.DefaultSpeciesSet, neat.DefaultStagnation,
'config-file-path')
# 定义适应度函数
def eval_genomes(genomes, config):
for genome_id, genome in genomes:
net = create_phenotype_network(genome, config)
# 计算适应度
genome.fitness = calculate_fitness(net)
# 创建种群
p = neat.Population(config)
# 运行种群
winner = p.run(eval_genomes, 100)
ES-HyperNEAT 实验
与 HyperNEAT 类似,但不需要声明隐藏节点,并使用 es_hyperneat
模块中的 create_phenotype_network
方法。
3. 应用案例和最佳实践
应用案例
PUREPLES 可以用于解决各种需要大规模神经网络的任务,例如:
- 机器人控制
- 游戏 AI
- 图像识别
最佳实践
- 参数调优:在运行实验时,根据具体任务调整 NEAT 和 HyperNEAT 的参数,以获得最佳性能。
- 基底设计:在 ES-HyperNEAT 中,基底的设计对结果有重要影响,建议根据任务的特性设计合适的基底。
4. 典型生态项目
- neat-python:PUREPLES 依赖于 neat-python,这是一个实现 NEAT 算法的 Python 库。
- OpenAI Gym:PUREPLES 可以与 OpenAI Gym 结合使用,用于强化学习任务。
通过以上步骤,你可以快速上手并使用 PUREPLES 进行神经进化实验。