探索高效采样:minimc开源项目介绍
minimcJust a little MCMC项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mi/minimc
项目介绍
minimc 是一个专注于马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)算法实现的开源库。该项目旨在提供MCMC算法的参考实现,特别是基于Michael Betancourt的《A Conceptual Introduction to Hamiltonian Monte Carlo》论文中的理念。minimc的核心亮点是其简洁而高效的Hamiltonian Monte Carlo(HMC)实现,仅用约15行代码即可完成,依赖于一个8行代码的积分器。
项目技术分析
minimc库目前实现了多种关键功能,包括步长调整、蛙跳积分器、Hamiltonian Monte Carlo算法以及一些对数概率函数(如正态分布、多元正态分布、混合分布和漏斗分布)。此外,minimc还计划在未来版本中加入更多高级功能,如 divergences、质量矩阵自适应、诊断工具、No-U-Turn Sampler(NUTS)、经验HMC以及黎曼流形HMC等。
项目及技术应用场景
minimc适用于需要高效采样和参数估计的多种场景,特别是在统计学、机器学习、数据科学和物理学等领域。例如,在贝叶斯统计中,minimc可以用于后验分布的采样;在机器学习模型中,可以用于参数的优化和不确定性量化;在物理模拟中,可以用于粒子系统的动力学模拟。
项目特点
- 简洁高效:minimc的HMC实现极为简洁,代码量少且易于理解和修改。
- 教育性:代码注释详细,适合作为学习和教学材料。
- 模块化设计:各个功能模块独立,便于扩展和定制。
- 活跃的开发路线图:项目持续更新,不断引入新的算法和功能。
安装与使用
minimc可以通过pip安装,建议直接从GitHub克隆源码进行深入探索:
pip install git+git://github.com/colcarroll/minimc.git
以下是一个简单的使用示例:
import autograd.numpy as np
from minimc import neg_log_normal, hamiltonian_monte_carlo
samples = hamiltonian_monte_carlo(2_000, neg_log_normal(0, 0.1), initial_position=0.)
通过这些示例,您可以快速上手并利用minimc进行高效的MCMC采样。
minimc不仅是一个功能强大的MCMC工具,也是一个极佳的学习资源。无论您是研究人员、开发者还是学生,minimc都能为您提供一个高效、灵活且易于理解的MCMC实现平台。立即尝试,探索更多可能!
minimcJust a little MCMC项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mi/minimc