CAML-MIMIC：可解释的医疗代码预测模型

CAML-MIMIC：可解释的医疗代码预测模型

caml-mimic multilabel classification of EHR notes 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ca/caml-mimic

项目简介

CAML-MIMIC是一个开源项目，其代码库旨在支持论文《从临床文本中可解释的医学代码预测》的研究。该项目的主要目标是通过自然语言处理（NLP）技术，以可解释的方式预测医学文档中的疾病和程序代码。遗憾的是，当前项目已被存档，但仍然提供代码供社区参考。

项目技术分析

CAML-MIMIC使用了PyTorch 0.3.0作为深度学习框架，并依赖于tqdm，scikit-learn，numpy，scipy，pandas，jupyter notebook，gensim和nltk等库。该项目的架构包括一个卷积神经网络（CNN），名为CAML，以及一个改进版的CAML——DR-CAML，它能更好地结合上下文信息进行预测。

数据预处理部分，项目提供了Python脚本，用于整理MIMIC-II和MIMIC-III数据集，这两个数据集均需要自行获取。这些脚本会创建所需的数据结构，并可选择预先训练词嵌入以加快处理速度。

应用场景

CAML-MIMIC适用于医疗信息系统的开发，尤其在自动化电子健康记录（EHR）编码方面。通过对临床文本的理解，模型可以帮助医生快速准确地分类和编码患者的疾病与治疗情况。此外，由于其可解释性，该模型也可用于教学，帮助医学生理解复杂的医学诊断过程。

项目特点

1. 可解释性：模型的预测结果可以解释，这在医疗领域至关重要，因为它要求决策的透明性和可理解性。
2. 针对特定领域的应用：专为医学文献设计，对ICD代码的预测精度高。
3. 开放源码：虽然不再维护更新，但源代码仍然可供研究者参考和复现实验结果。
4. 数据处理工具：提供了自动化数据预处理流程，简化了数据准备步骤。

要体验CAML-MIMIC的强大功能，只需按照提供的指南设置环境，加载MIMIC数据集，运行预处理脚本，并利用预训练模型或自定义参数训练新模型。如果你有兴趣探索医疗文本的深度学习应用，这是一个绝佳的起点。

caml-mimic multilabel classification of EHR notes 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ca/caml-mimic