**Brainglobe Atlas API使用手册**

Brainglobe Atlas API使用手册

bg-atlasapi A lightweight python module to interact with atlases for systems neuroscience 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/bg/bg-atlasapi

1. 目录结构及介绍

Brainglobe Atlas API 的项目目录组织严谨，便于开发者快速定位需要的组件和资源。以下是主要目录及其功能简介：

• ./ 根目录下包含了项目的核心代码和重要文件。

  • LICENSE: 项目使用的许可证文件，遵循BSD-3-Clause协议。
  • README.md: 项目简介、安装指南、使用示例等综合信息。
  • pyproject.toml: 确定Python项目依赖和编译设置的配置文件。
  • MANIFEST.in: 控制额外需要包含在分发包中的非Python文件。
  • codecov.yml, .gitignore, pre-commit-config.yaml: 分别用于代码覆盖率报告配置、Git忽略文件配置以及预提交检查配置。

• ./codebase: 假设的子目录，实际的Python源码通常存放于此，但具体细节未直接提供。

  • 包含核心库文件如brainglobe_atlasapi.py，实现与脑图谱交互的主要逻辑。
  • 可能会有其他模块，如bg_atlas，用来定义BrainGlobeAtlas类等关键接口。

• ./tests: 测试代码所在目录，确保项目功能的稳定性和正确性。

• ./tutorials: 教程或样例代码，帮助新用户快速上手。

• ./github/workflows: CI/CD的工作流配置文件，自动化构建和测试流程。

• docs: 可能包含更详细的官方文档，指导用户深入理解项目。

• CITATION.cff: 引用该项目的标准方式，鼓励使用者正确引用其贡献。

2. 项目的启动文件介绍

虽然“启动文件”一词常与应用程序相关联，但对于一个Python库如Brainglobe Atlas API，其“启动”更多指的是导入并使用库的功能。因此，用户无需直接操作特定的“启动文件”。使用时，通过Python脚本或者命令行使用pip安装后，在自己的应用中通过以下方式启动使用：

import brainglobe_atlasapi

# 示例：展示可用的atlases
brainglobe_atlasapi.show_atlases()

这意味着用户的主程序或脚本即为项目的“启动点”。

3. 项目的配置文件介绍

Brainglobe Atlas API本身并没有明确提及外部配置文件，它更多依赖于内部定义的参数和环境变量。对于使用该API的应用来说，可能的配置需求体现在：

• 环境配置：确保Python版本兼容（>=3.6）且已安装必要的依赖。
• 运行时配置：开发者可能需通过代码来指定特定的atlas版本或路径，但这不是通过传统配置文件完成的，而是直接在代码中进行调用和参数设定。

若需定制化配置，用户可能自定义环境变量或在他们的应用代码中设置选项，但这部分灵活性属于高级使用场景，并非项目核心特性的直接组成部分。

总结，Brainglobe Atlas API强调的是通过Python编程接口来进行配置和使用，而不是依赖传统的配置文件系统。

bg-atlasapi A lightweight python module to interact with atlases for systems neuroscience 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/bg/bg-atlasapi