MethylDackel 项目教程
1. 项目的目录结构及介绍
MethylDackel 项目的目录结构如下:
MethylDackel/
├── CMakeLists.txt
├── LICENSE
├── README.md
├── bin
│ └── MethylDackel
├── docs
│ ├── CONTRIBUTING.md
│ └── ...
├── src
│ ├── main.cpp
│ ├── ...
└── tests
├── test_methyldackel.cpp
└── ...
目录结构介绍
- CMakeLists.txt: 项目的 CMake 构建文件。
- LICENSE: 项目的开源许可证文件。
- README.md: 项目的介绍和使用说明。
- bin: 存放编译后的可执行文件。
- docs: 存放项目的文档文件,包括贡献指南等。
- src: 存放项目的源代码文件。
- tests: 存放项目的测试代码文件。
2. 项目的启动文件介绍
项目的启动文件是 src/main.cpp
。这个文件包含了程序的主入口点,负责初始化程序并调用其他模块的功能。
启动文件介绍
- main.cpp: 主程序入口文件,负责初始化和启动程序。
3. 项目的配置文件介绍
MethylDackel 项目没有明确的配置文件,其配置主要通过命令行参数进行。用户可以通过命令行指定参考基因组文件、BAM 文件、输出文件等。
配置文件介绍
- 命令行参数: 通过命令行参数进行配置,例如指定参考基因组文件、BAM 文件、输出文件等。
示例命令:
MethylDackel extract reference_genome.fa alignments.bam
以上命令将使用 reference_genome.fa
作为参考基因组文件,处理 alignments.bam
文件,并输出结果。
通过以上内容,您可以了解 MethylDackel 项目的目录结构、启动文件和配置方式。