推荐文章：深度探索癌症的克隆进化 —— ClonEvol

姚月梅Lane

于 2024-09-08 09:44:06 发布

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推荐文章：深度探索癌症的克隆进化 —— ClonEvol

clonevolInferring and visualizing clonal evolution in multi-sample cancer sequencing项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/cl/clonevol

在癌症研究的浩瀚星空中，每一个突变都像是星辰，标记着肿瘤发展的轨迹。今天，我们带您深入了解一个开源工具——ClonEvol，它如同一位智慧的导航者，引领科学家们穿过复杂多变的癌症克隆演化迷雾。

项目介绍

ClonEvol，一款强大且专业的软件，专为解析和可视化多样本癌症测序中的克隆进化而设计。自其在《Annals of Oncology》发表以来，ClonEvol已成为研究癌症演化的首选工具之一。借助这份详细的教程，即便是新手也能迅速上手，探索肿瘤内部的克隆战争。

项目技术分析

ClonEvol的核心在于其高效的算法，能够从大量的癌症测序数据中提取出克隆结构信息，并通过直观的图形展示出来。最近的重大更新包括引入了“细胞球”视图与注释分支为基础的克隆进化树，这些革新大大提高了对复杂克隆关系的理解与解析能力。用户可以清晰地看到每个突变如何一步步累积，形成最终的肿瘤形态，如aml1案例所示，原始模型与ClonEvol重构的模型之间的对比令人印象深刻（见下图）。

ClonEvol示例

项目及技术应用场景

在癌症研究领域，ClonEvol的应用极为广泛，从急性骨髓性白血病的复发机制到甲状腺癌的克隆演变，再到结直肠癌的异质性研究，众多研究已采用ClonEvol剖析肿瘤内部的演变过程。这些应用不仅增进了我们对癌症进展的理解，还指导了个体化治疗策略的发展，如通过识别主导克隆来预测药物反应或监测疾病的进展和复发。