Nullarbor 项目使用文档

Nullarbor 项目使用文档

nullarbor :floppy_disk: :page_with_curl: "Reads to report" for public health and clinical microbiology 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/nu/nullarbor

1. 项目目录结构及介绍

Nullarbor 项目的目录结构如下：

nullarbor/
├── bin/
│   ├── nullarbor.pl
│   └── ...
├── lib/
│   ├── Nullarbor/
│   │   ├── Pipeline.pm
│   │   └── ...
│   └── ...
├── templates/
│   ├── report/
│   │   ├── index.html
│   │   └── ...
│   └── ...
├── config/
│   ├── nullarbor.conf
│   └── ...
├── data/
│   └── ...
├── README.md
└── ...

目录介绍：

• bin/: 包含项目的可执行文件，如 nullarbor.pl。
• lib/: 包含项目的 Perl 模块，如 Nullarbor::Pipeline.pm。
• templates/: 包含报告模板文件，如 index.html。
• config/: 包含项目的配置文件，如 nullarbor.conf。
• data/: 包含项目的数据文件。
• README.md: 项目的说明文档。

2. 项目启动文件介绍

项目的启动文件是 bin/nullarbor.pl。该文件是 Nullarbor 项目的主脚本，负责执行项目的核心功能。

启动文件功能：

• 解析命令行参数。
• 加载配置文件。
• 调用相应的 Perl 模块执行数据处理和报告生成。

3. 项目配置文件介绍

项目的配置文件位于 config/nullarbor.conf。该文件包含了项目的各种配置选项，用于定制项目的运行行为。

配置文件内容：

• 数据库连接信息: 配置数据库的连接参数。
• 报告模板路径: 指定报告模板文件的路径。
• 数据处理参数: 配置数据处理的参数，如输入文件路径、输出目录等。

通过修改配置文件，用户可以根据自己的需求定制 Nullarbor 项目的运行方式。

nullarbor :floppy_disk: :page_with_curl: "Reads to report" for public health and clinical microbiology 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/nu/nullarbor