sknw：Python中的骨架分析库

sknw：Python中的骨架分析库

sknwbuild net work from skeleton image (2D-3D)项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/sk/sknw

项目介绍

sknw 是一个用于二维和三维骨架图像构建网络的Python库。它灵感来源于Juan的算法，旨在提供骨架分析的功能，帮助开发者和研究人员处理和分析图像中的骨骼结构。此库是ImagePy开源图像处理框架的一个子模块，而ImagePy被誉为Python界的ImageJ，允许轻松封装基于NumPy的任何图像处理函数。

项目快速启动

要开始使用sknw，首先确保你的环境中已安装了必要的依赖项。接下来，通过pip安装sknw：

pip install sknw

安装完成后，你可以快速地从骨架图中构建网络并进行基本操作。以下是一个简单的示例，演示如何加载骨架图像，构建其对应的图形结构，并简单绘制节点和边：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import sknw

# 假设 'skeleton.png' 是一个二值化的骨架图像
# img = plt.imread('skeleton.png')  # 实际使用时，解注释这行来载入你的图像

# 对于示例目的，我们创建一个简单的骨架图像模拟
# 这里需要替换为实际的图像处理步骤以获取骨架图像
# img = ... 

# 使用sknw构建图
graph = sknw.build_sknw(img)

# 提取节点并绘制
nodes = graph.nodes()
ps = np.array([nodes[i]['o'] for i in nodes])
plt.plot(ps[:,1], ps[:,0], 'green')  # 绘制节点
plt.plot(ps[:-1,1], ps[:-1,0], 'r-', ps[1:,1], ps[1:,0], 'r-')  # 绘制边
plt.title('构建的骨架网络')
plt.show()

应用案例和最佳实践

在研究或工程实践中，sknw常被用来分析图像中的线条结构，例如血管网络、树枝分布或者电路板走线等。一个最佳实践包括：

1. 预处理：使用图像处理技术（如二值化、去噪）准备骨架图像。
2. 骨架提取：将二值图像转换成骨架，这一步骤往往需要特定的算法实现，sknw假设你已经有了骨架图像。
3. 网络构建：调用sknw.build_sknw()构建骨架网络模型。
4. 分析：利用构建的网络数据，进行节点重要性评估、路径寻找或拓扑属性的计算。
5. 可视化：利用Matplotlib或其他可视化工具展示分析结果，帮助理解或验证分析过程。

典型生态项目

作为ImagePy的一部分，sknw嵌入在一个更广阔的图像处理生态系统之中，支持复杂的图像分析工作流。例如，在神经科学领域，可以结合ImagePy的其他模块对脑组织切片中的神经纤维网络进行量化分析；在城市规划中，用以分析道路网的连通性和布局优化。

对于那些需要高级图像处理或希望定制功能的用户，ImagePy提供了丰富的插件系统，使得集成和扩展功能变得容易，比如增加新的骨架提取算法或者与其他图像分析工具集成。

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本教程简要介绍了如何开始使用sknw库，以及它在不同应用场景中的潜力。深入探索sknw及其背后的ImagePy框架，能够解锁更多图像分析的强大能力。

sknwbuild net work from skeleton image (2D-3D)项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/sk/sknw