QuPath 开源项目安装与使用指南

QuPath 开源项目安装与使用指南

qupathQuPath - Bioimage analysis & digital pathology项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/qu/qupath

目录结构及介绍

QuPath是用于生物图像分析和数字病理学的一款强大工具，其代码库在GitHub上开放。由于QuPath是一个应用软件，并非传统的开发框架或库，其“项目”概念与一般理解的编程项目不同。因此，在传统意义上的目录结构描述可能不适用于QuPath这样的成品软件。然而，当我们下载QuPath的源代码时，可以大致看到以下结构：

qupath/
|-- .git
|-- .github
|   |-- workflows
|-- gradle
|   |-- wrapper
|-- src
|   |-- main
|       |-- java
|       |   |-- org
|           |-- qupath
|-- docs
|-- build.gradle
|-- settings.gradle
|-- README.md
...

• src/main/java/org/qupath: 包含了所有的Java源代码。
• .gradle 和 build.gradle: Gradle构建脚本及其缓存目录。
• .github/workflows: Github工作流（自动构建测试等）定义。
• docs: 文档和资源文件。

启动文件介绍

QuPath作为一个跨平台的应用程序，其启动方式依赖于您的操作系统:

对于Windows用户

• Download for Windows: 提供MSI安装包和ZIP压缩包，用于便携式版本。

对于macOS用户

• Download for macOS: 可以选择Intel或者Apple Silicon编译版的PKG安装包。

对于Linux用户

• Download for Linux: 可以获取TAR.XZ的压缩包进行手动解压并运行。

实际的启动文件通常是.jar文件（可执行的Java档案），但在标准发行版中通常被封装在应用程序包内。

配置文件介绍

QuPath的大部分设置可以通过其图形界面中的菜单项进行调整。然而，QuPath也支持通过修改配置文件来改变一些高级设置。这些文件主要存储在用户的主目录下的隐藏目录中：

• 在Windows系统中，路径通常为%APPDATA%\QuPath.
• 在macOS系统中，路径通常为~/Library/Application Support/QuPath.
• 在Linux系统中，路径通常为~/.config/QuPath.

其中包含有application.properties和其他相关配置文件，例如用于自定义颜色方案和用户预设的文件。

在application.properties中，你可以找到如数据库位置、语言偏好等设置。要注意的是，对这些文件做任何更改前，应该确保备份原始文件，防止意外丢失重要设置。

以上就是基于QuPath项目的一份简要的目录结构说明以及如何启动和配置该项目的基本方法。对于更详细的开发指导，建议参考QuPath的官方文档以及贡献者指南。

qupathQuPath - Bioimage analysis & digital pathology项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/qu/qupath