nnFormer 开源项目使用教程
nnFormer项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/nn/nnFormer
1. 项目的目录结构及介绍
nnFormer 项目的目录结构如下:
nnFormer/
├── nnformer/
│ ├── inference/
│ ├── network_architecture/
│ ├── run/
│ ├── training/
│ ├── dataset_json/
│ ├── inference_acdc.py
│ ├── inference_synapse.py
│ ├── inference_tumor.py
│ ├── predict_simple.py
│ ├── nnFormer_acdc.py
│ ├── nnFormer_synapse.py
│ ├── nnFormer_tumor.py
│ ├── run_training.py
│ ├── nnFormerTrainerV2_nnformer_acdc.py
│ ├── nnFormerTrainerV2_nnformer_synapse.py
│ ├── nnFormerTrainerV2_nnformer_tumor.py
├── LICENSE
├── README.md
├── environment.yml
├── setup.py
├── train_inference.sh
目录结构介绍
-
nnformer/
: 项目的主要代码目录。inference/
: 包含用于推理的脚本。network_architecture/
: 包含网络架构的定义。run/
: 包含运行训练的脚本。training/
: 包含训练网络的脚本。dataset_json/
: 包含数据集的 JSON 文件。inference_acdc.py
,inference_synapse.py
,inference_tumor.py
: 用于不同数据集的推理脚本。predict_simple.py
: 简单的预测脚本。nnFormer_acdc.py
,nnFormer_synapse.py
,nnFormer_tumor.py
: 不同数据集的网络架构定义。run_training.py
: 运行训练的脚本。nnFormerTrainerV2_nnformer_acdc.py
,nnFormerTrainerV2_nnformer_synapse.py
,nnFormerTrainerV2_nnformer_tumor.py
: 不同数据集的训练器定义。
-
LICENSE
: 项目的许可证文件。 -
README.md
: 项目的说明文档。 -
environment.yml
: 项目的依赖环境配置文件。 -
setup.py
: 项目的安装脚本。 -
train_inference.sh
: 训练和推理的脚本。
2. 项目的启动文件介绍
启动文件
train_inference.sh
: 该脚本用于启动训练和推理过程。
使用方法
./train_inference.sh
3. 项目的配置文件介绍
配置文件
environment.yml
: 该文件定义了项目运行所需的环境依赖。
使用方法
conda env create -f environment.yml
source activate nnFormer
通过以上步骤,您可以成功配置并启动 nnFormer 项目。