nnFormer 开源项目使用教程

nnFormer 开源项目使用教程

nnFormer项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/nn/nnFormer

1. 项目的目录结构及介绍

nnFormer 项目的目录结构如下：

nnFormer/
├── nnformer/
│   ├── inference/
│   ├── network_architecture/
│   ├── run/
│   ├── training/
│   ├── dataset_json/
│   ├── inference_acdc.py
│   ├── inference_synapse.py
│   ├── inference_tumor.py
│   ├── predict_simple.py
│   ├── nnFormer_acdc.py
│   ├── nnFormer_synapse.py
│   ├── nnFormer_tumor.py
│   ├── run_training.py
│   ├── nnFormerTrainerV2_nnformer_acdc.py
│   ├── nnFormerTrainerV2_nnformer_synapse.py
│   ├── nnFormerTrainerV2_nnformer_tumor.py
├── LICENSE
├── README.md
├── environment.yml
├── setup.py
├── train_inference.sh

目录结构介绍

• nnformer/: 项目的主要代码目录。

  • inference/: 包含用于推理的脚本。
  • network_architecture/: 包含网络架构的定义。
  • run/: 包含运行训练的脚本。
  • training/: 包含训练网络的脚本。
  • dataset_json/: 包含数据集的 JSON 文件。
  • inference_acdc.py, inference_synapse.py, inference_tumor.py: 用于不同数据集的推理脚本。
  • predict_simple.py: 简单的预测脚本。
  • nnFormer_acdc.py, nnFormer_synapse.py, nnFormer_tumor.py: 不同数据集的网络架构定义。
  • run_training.py: 运行训练的脚本。
  • nnFormerTrainerV2_nnformer_acdc.py, nnFormerTrainerV2_nnformer_synapse.py, nnFormerTrainerV2_nnformer_tumor.py: 不同数据集的训练器定义。

• LICENSE: 项目的许可证文件。

• README.md: 项目的说明文档。

• environment.yml: 项目的依赖环境配置文件。

• setup.py: 项目的安装脚本。

• train_inference.sh: 训练和推理的脚本。

2. 项目的启动文件介绍

启动文件

• train_inference.sh: 该脚本用于启动训练和推理过程。

使用方法

./train_inference.sh

3. 项目的配置文件介绍

配置文件

• environment.yml: 该文件定义了项目运行所需的环境依赖。

使用方法

conda env create -f environment.yml
source activate nnFormer

通过以上步骤，您可以成功配置并启动 nnFormer 项目。

nnFormer项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/nn/nnFormer