NCLS 开源项目教程

NCLS 开源项目教程

nclsThe Nested Containment List for Python. Basically a static interval-tree that is silly fast for both construction and lookups.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/nc/ncls

1. 项目的目录结构及介绍

ncls/
├── LICENSE
├── README.md
├── setup.py
├── ncls/
│   ├── __init__.py
│   ├── interval_tree.py
│   ├── ncls.py
│   ├── ncls32.py
│   ├── ncls64.py
│   └── utils.py
└── tests/
    ├── __init__.py
    ├── test_ncls.py
    └── test_utils.py

• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目说明文档。
• setup.py: 项目安装脚本。
• ncls/: 项目主目录，包含所有核心代码文件。
  • __init__.py: 初始化文件，使 ncls 目录成为一个 Python 包。
  • interval_tree.py: 区间树实现文件。
  • ncls.py: 主要功能实现文件。
  • ncls32.py: 32 位实现文件。
  • ncls64.py: 64 位实现文件。
  • utils.py: 工具函数文件。
• tests/: 测试目录，包含所有测试文件。
  • __init__.py: 初始化文件，使 tests 目录成为一个 Python 包。
  • test_ncls.py: 主要功能测试文件。
  • test_utils.py: 工具函数测试文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 ncls/__init__.py，这个文件负责初始化 ncls 包，并导入了主要的功能模块。

from .ncls import NCLS
from .ncls32 import NCLS32
from .ncls64 import NCLS64

通过这个文件，用户可以方便地导入并使用 NCLS、NCLS32 和 NCLS64 类。

3. 项目的配置文件介绍

项目没有显式的配置文件，所有的配置和参数传递都是通过代码中的函数和类来完成的。例如，创建一个 NCLS 对象时，需要传入区间数据：

import numpy as np
from ncls import NCLS

starts = np.array([0, 10, 20])
ends = np.array([5, 15, 25])
ids = np.array([1, 2, 3])

ncls = NCLS(starts, ends, ids)

在这个例子中，starts、ends 和 ids 是传递给 NCLS 类的参数，用于构建区间树。

nclsThe Nested Containment List for Python. Basically a static interval-tree that is silly fast for both construction and lookups.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/nc/ncls