XAI-for-bioinformatics 项目使用教程

XAI-for-bioinformatics 项目使用教程

XAI-for-bioinformatics Explainable AI for Bioinformatics 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/xa/XAI-for-bioinformatics

1. 项目目录结构及介绍

XAI-for-bioinformatics/
├── datasets/
│   └── ...
├── notebooks/
│   └── ...
├── LICENSE
├── README.md
└── ...

• datasets/: 包含项目使用的数据集文件。
• notebooks/: 包含多个交互式 Jupyter 笔记本，展示如何使用可解释的机器学习技术来提高生物信息学研究的可解释性。
• LICENSE: 项目的许可证文件，采用 MIT 许可证。
• README.md: 项目的介绍文件，包含项目的概述、使用方法和相关资源。

2. 项目的启动文件介绍

项目中没有明确的“启动文件”，但主要的交互式代码和演示都在 notebooks/ 目录下的 Jupyter 笔记本中。用户可以通过启动 Jupyter Notebook 服务来运行这些笔记本。

启动 Jupyter Notebook

1. 安装 Jupyter Notebook：

   pip install jupyterlab
   

2. 启动 Jupyter Notebook：

   jupyter notebook
   

3. 在浏览器中打开 Jupyter Notebook 界面，导航到 notebooks/ 目录，选择相应的笔记本文件进行运行。

3. 项目的配置文件介绍

项目中没有明确的配置文件，但用户可以根据需要在 Jupyter 笔记本中进行配置。例如，数据集的路径、模型的参数等可以在笔记本中进行设置。

示例配置

在某个 Jupyter 笔记本中，用户可以设置数据集路径：

# 设置数据集路径
dataset_path = 'datasets/example_dataset.csv'

用户可以根据具体需求在笔记本中进行相应的配置。

XAI-for-bioinformatics Explainable AI for Bioinformatics 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/xa/XAI-for-bioinformatics