DiffusionMBIR 开源项目教程
DiffusionMBIR项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/di/DiffusionMBIR
1. 项目目录结构及介绍
DiffusionMBIR/
├── config/ # 配置文件夹
│ ├── AAPM256_config.py # AAPM数据集的配置示例
│ └── BRATS_config.py # BRATS MRI数据集的配置示例
├── data/ # 数据存储位置(需用户自行准备)
│ └── MRI/ # 包含BRATS等MRI数据子目录
├── models/ # 模型权重存储
├── scripts/ # 脚本文件夹
│ ├── train_AAPM256.sh # 训练AAPM数据集的bash脚本
│ └── inverse_problem_solver_.py # 反问题求解器脚本
└── src/ # 源代码库
├── datasets/ # 数据加载模块
├── models/ # 模型定义
├── utils/ # 辅助工具函数
├── inverse_problem_solver.py # 主逆问题解决者
└── trainer.py # 训练模块
项目结构清晰,主要分为以下几个部分:
config/
: 存放不同数据集的配置文件。data/
: 用户应将MRI数据下载到此目录,并按规定的结构组织。models/
: 存储训练好的模型权重。scripts/
: 提供训练和测试脚本。src/
: 项目的核心代码,包括数据加载、模型定义、反问题求解和训练模块。
2. 项目的启动文件介绍
inverse_problem_solver_.py
这是执行反问题求解的主要脚本。你可以通过修改其中的参数设置来调整实验环境,比如选择使用的配置文件、模型权重路径以及重建图像的设置。例如,如果你要使用AAPM数据集,可以调用AAPM256_config.py
中的配置。
train_AAPM256.sh
这是一个bash脚本,用于训练AAPM数据集的扩散模型。你可以根据需要修改训练参数或数据集路径。运行这个脚本将启动训练过程。
3. 项目的配置文件介绍
config/*.py
配置文件如AAPM256_config.py
和BRATS_config.py
提供了实验设置的具体细节,包括数据路径、模型结构、优化器参数、学习率策略等。用户可以根据自己的数据集和需求修改这些配置项来定制实验。
例如,在AAPM256_config.py
中,你可以看到数据加载的配置(如数据路径),模型参数(如层数、通道数)和训练参数(如批次大小、最大迭代次数)。务必确保在运行前已正确地将数据路径指向了你的数据所在的位置。
请确保在实际使用时,根据你自己的硬件资源和数据集调整这些配置以达到最佳效果。对于自定义的数据集,你需要创建新的配置文件并更新相关的数据加载部分。
DiffusionMBIR项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/di/DiffusionMBIR