MultiPlanarUNet 项目安装与使用指南

MultiPlanarUNet 项目安装与使用指南

MultiPlanarUNetMulti-Planar UNet for autonomous segmentation of 3D medical images项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mu/MultiPlanarUNet

1. 项目目录结构及介绍

MultiPlanarUNet/
├── MultiPlanarUNet/
│   ├── __init__.py
│   ├── ... (其他Python模块文件)
├── scripts/
│   ├── cv_experiment.py
│   ├── cv_split.py
│   ├── init_project.py
│   ├── predict.py
│   ├── predict_3D.py
│   ├── summary.py
│   ├── train.py
│   ├── train_fusion.py
├── setup.py
├── README.md
├── requirements.txt
├── ... (其他配置文件和文档)

目录结构说明

• MultiPlanarUNet/: 项目的主要代码目录，包含所有Python模块文件。
• scripts/: 包含项目的各种脚本文件，如交叉验证实验、项目初始化、预测、训练等。
• setup.py: 项目的安装脚本。
• README.md: 项目的介绍文档。
• requirements.txt: 项目依赖的Python包列表。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件主要位于 scripts/ 目录下，以下是一些关键的启动文件及其功能介绍：

• cv_experiment.py: 用于执行交叉验证实验的脚本。
• cv_split.py: 用于分割数据集的脚本。
• init_project.py: 用于初始化新项目的脚本。
• predict.py: 用于执行预测任务的脚本。
• predict_3D.py: 用于执行3D预测任务的脚本。
• summary.py: 用于生成项目摘要的脚本。
• train.py: 用于训练模型的脚本。
• train_fusion.py: 用于训练融合模型的脚本。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要包括以下几个部分：

• hyperparamter.py: 包含项目的超参数配置，如模型结构、训练参数等。
• requirements.txt: 列出了项目运行所需的Python包及其版本。
• setup.py: 用于安装项目的配置文件，定义了项目的元数据和依赖关系。

配置文件示例

# hyperparamter.py

# 模型结构配置
model_config = {
    "input_shape": (256, 256, 256),
    "num_classes": 2,
    "filters": 64,
    "depth": 4,
    "batch_size": 8,
    "epochs": 100
}

# 训练参数配置
training_config = {
    "learning_rate": 0.001,
    "optimizer": "adam",
    "loss_function": "binary_crossentropy"
}

通过以上配置文件，用户可以自定义模型的结构和训练参数，以适应不同的任务需求。

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以上是 MultiPlanarUNet 项目的安装与使用指南，希望对您有所帮助。

MultiPlanarUNetMulti-Planar UNet for autonomous segmentation of 3D medical images项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mu/MultiPlanarUNet