ROSS:一款强大的离线尖峰排序软件
ROSSRobust Offline Spike Sorter项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ro/ROSS
项目介绍
ROSS是一款基于MATLAB的离线尖峰排序软件,旨在帮助研究人员高效地进行自动和手动尖峰排序任务。该软件的核心算法基于论文《An automatic spike sorting algorithm based on adaptive spike detection and a mixture of skew-t distributions》,并已在Nature旗下的Scientific Reports上发表。ROSS不仅提供了基于t分布和偏斜t分布的自动尖峰排序方法,还提供了多种可视化工具和手动排序功能,以帮助用户获得更精确的结果。
项目技术分析
ROSS的核心技术包括:
- 自动尖峰检测:通过加载原始的细胞外数据,用户可以调整滤波和阈值设置,然后通过点击“开始检测”按钮,检测结果将以PCA图的形式呈现。
- 自动排序:ROSS实现了五种不同的自动排序方法,包括偏斜t分布、t分布、GMM、k-means和模板匹配。用户可以根据需要配置算法参数。
- 手动排序:提供了多种手动修改工具,如合并、删除、重新排序、去噪等,用户可以在PCA域中手动分组或删除样本。
- 可视化工具:提供了多种2D和3D可视化工具,包括尖峰间隔、神经元存活时间、波形、3D图和PCA域图,用户还可以在原始数据上跟踪检测到的尖峰。
项目及技术应用场景
ROSS主要应用于神经科学领域,特别是在神经活动的监测和分析中。其应用场景包括:
- 神经科学研究:研究人员可以使用ROSS对记录的细胞外电位数据进行尖峰排序,以区分不同的神经元活动。
- 脑机接口:在脑机接口研究中,ROSS可以帮助研究人员对神经信号进行精确的分类和分析。
- 临床应用:在神经疾病的诊断和治疗中,ROSS可以用于分析患者的神经活动数据,帮助医生制定更有效的治疗方案。
项目特点
- 强大的自动排序功能:ROSS提供了多种自动排序方法,用户可以根据数据特点选择最适合的算法。
- 灵活的手动排序工具:提供了多种手动修改工具,用户可以对自动排序结果进行精细调整。
- 丰富的可视化功能:提供了多种2D和3D可视化工具,帮助用户更好地理解和分析数据。
- 跨平台支持:除了MATLAB版本外,ROSS还提供了基于Python的版本,方便不同平台的用户使用。
ROSS是一款功能强大且易于使用的尖峰排序软件,无论您是神经科学研究人员还是脑机接口开发者,ROSS都能为您提供高效、精确的尖峰排序解决方案。立即访问ROSS GitHub页面,开始您的尖峰排序之旅吧!
ROSSRobust Offline Spike Sorter项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ro/ROSS