Tomviz 开源项目教程
项目介绍
Tomviz 是一个跨平台的开源应用程序,用于处理、可视化和分析 3D 断层扫描数据。它提供了一个完整的处理管道,从数据对齐、重建和分割到显示、可视化和与 3D 断层扫描数据重建的交互。许多数据操作器都可以作为可编辑的 Python 脚本,可以在界面中修改以尝试不同的技术。该管道可以保存到磁盘,并且支持多种常见文件格式进行数据导入和导出。
项目快速启动
安装
Windows
- 下载
Tomviz-1.10.0.msi
文件。 - 双击安装文件并按照提示完成安装。
- 双击桌面上的 Tomviz 图标启动应用程序。
macOS
- 下载
Tomviz-1.10.0.dmg
文件。 - 双击打开 dmg 文件,将 Tomviz 拖动到应用程序文件夹。
- 第一次打开时,右键点击应用程序图标并选择“打开”,然后点击“打开”按钮。
Linux
- 下载
Tomviz-1.10.0-Linux.tar.gz
文件。 - 使用以下命令解压文件:
tar zxvf Tomviz-1.10.0-Linux.tar.gz
- 进入解压后的目录,运行
./bin/tomviz
启动应用程序。
快速使用
- 打开 Tomviz 应用程序。
- 通过点击“样本菜单 > 重建”打开一个样本数据集。
- 通过点击“可视化 > 体积”创建一个 3D 体积可视化。
- 在中心面板“RenderView”中与您的体积进行交互。
应用案例和最佳实践
案例一:纳米颗粒的电子断层扫描
使用 Tomviz 进行纳米颗粒的电子断层扫描,可以实现全范围的电子断层扫描,适用于纳米颗粒和细粉末的分析。通过 Tomviz 的交互式界面,可以实时调整参数并观察结果,提高分析效率。
案例二:3D 体积可视化
Tomviz 提供了强大的 3D 体积可视化功能,适用于医学影像、材料科学等领域的数据可视化。通过调整不同的可视化参数,可以获得更直观的数据展示效果。
典型生态项目
OpenChemistry
OpenChemistry 是一个开源项目集合,旨在提供化学和材料科学领域的工具和应用程序。Tomviz 是 OpenChemistry 项目的一部分,与其他项目如 Avogadro(分子建模工具)和 MolViz(分子可视化工具)共同构成了一个完整的生态系统。
VTK
VTK(Visualization Toolkit)是一个开源的图形库,广泛用于科学可视化。Tomviz 使用 VTK 进行 3D 可视化,提供了强大的图形渲染和交互功能。
通过以上模块的介绍和实践,您可以快速上手并深入了解 Tomviz 开源项目的使用和应用。