ciTools 开源项目教程

ciTools 开源项目教程

ciToolsAn R Package for Quick Uncertainty Intervals项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ci/ciTools

1. 项目的目录结构及介绍

ciTools 项目的目录结构如下：

ciTools/
├── DESCRIPTION
├── NAMESPACE
├── R/
│   ├── add_ci.R
│   ├── add_pi.R
│   ├── add_probs.R
│   ├── add_quantile.R
│   └── ...
├── man/
│   ├── add_ci.Rd
│   ├── add_pi.Rd
│   ├── add_probs.Rd
│   ├── add_quantile.Rd
│   └── ...
├── vignettes/
│   ├── Binomial_Regression_with_ciTools.Rmd
│   ├── Introducing_ciTools.Rmd
│   ├── Generalized_Linear_Models_with_ciTools.Rmd
│   ├── Mixed_models_with_ciTools.Rmd
│   └── ...
├── LICENSE
├── README.md
└── ...

目录介绍：

• DESCRIPTION: 项目的描述文件，包含项目的基本信息和依赖关系。
• NAMESPACE: 项目的命名空间文件，定义了导出的函数和导入的包。
• R/: 包含项目的所有 R 代码文件。
• man/: 包含项目的帮助文档文件。
• vignettes/: 包含项目的高级教程和示例文档。
• LICENSE: 项目的许可证文件。
• README.md: 项目的说明文件，包含项目的基本介绍和使用方法。

2. 项目的启动文件介绍

ciTools 项目的启动文件是 R/ 目录下的各个 R 代码文件。这些文件定义了项目的主要功能和接口。以下是一些关键的启动文件：

• add_ci.R: 定义了添加置信区间的函数。
• add_pi.R: 定义了添加预测区间的函数。
• add_probs.R: 定义了添加条件响应概率的函数。
• add_quantile.R: 定义了添加条件响应分位数的函数。

3. 项目的配置文件介绍

ciTools 项目的配置文件主要是 DESCRIPTION 和 NAMESPACE 文件。

DESCRIPTION 文件

DESCRIPTION 文件包含了项目的基本信息和依赖关系，例如：

Package: ciTools
Version: 0.6.1
Title: Confidence or Prediction Intervals, Quantiles and Probabilities for Statistical Models
Description: Functions to append confidence intervals, prediction intervals and other quantities of interest to data frames. All appended quantities are for the response variable after conditioning on the model and covariates. This package has a data frame first syntax that allows for easy piping. Currently supported models include (log-) linear, (log-) linear mixed, generalized linear models, generalized linear mixed models and accelerated failure time models.
License: GPL (>= 3)
Depends: R (>= 3.4.0)
Imports: arm, boot, dplyr, lme4, MASS, methods, stats, survival, utils
Suggests: here, ggplot2, knitr, rmarkdown, SPREDA
Author: John Haman [cre, aut]
Maintainer: John Haman <jhaman@ida.org>
BugReports: https://github.com/jthaman/ciTools/issues
URL: https://github.com/jthaman/ciTools

NAMESPACE 文件

NAMESPACE 文件定义了导出的函数和导入的包，例如：

export(add_ci, add_pi, add_probs, add_quantile)
import(arm, boot, dplyr, lme4, MASS, methods, stats, survival, utils)
importFrom(ggplot2, ggplot)

通过这些配置文件，用户可以了解项目的依赖关系和导出的函数，从而更好地使用和扩展项目。

ciToolsAn R Package for Quick Uncertainty Intervals项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ci/ciTools