MiniSom 自组织映射算法实现教程
1. 项目目录结构及介绍
以下是 Minisom
开源项目的基本目录结构:
.
├── examples # 示例代码
│ ├── example.py # 基本使用示例
├── gitignore # Git 忽略文件配置
├── LICENSE # 项目许可文件(MIT)
├── README.md # 项目说明文档
├── minisom.py # 主要的自组织映射(SOM)类定义
├── setup.cfg # 配置文件,用于构建和安装
└── setup.py # Python 安装脚本
examples
: 包含演示 MiniSom 库如何使用的代码。example.py
: 提供一个基础的示例,展示如何使用 MiniSom 进行训练和可视化。gitignore
: 规定在 Git 中忽略哪些不需要跟踪的文件类型。LICENSE
: 详细描述了项目的开源许可条款。README.md
: 对项目的基本介绍,包括功能、依赖和安装指南。minisom.py
: 项目的核心文件,实现了 SOM 算法。setup.cfg
和setup.py
: 用于配置和安装项目的文件。
2. 项目的启动文件介绍
由于 MiniSom 是一个 Python 模块,没有特定的“启动”文件,而是通过导入 minisom
模块来使用。下面是如何导入并使用 MiniSom 的基本示例:
from minisom import MiniSom
# 初始化 MiniSom 实例
som = MiniSom(x=10, y=10, input_len=3)
# 训练数据
data = [[0.1, 0.2, 0.3], [0.8, 0.7, 0.6], ...]
# 训练 SOM
som.train_random(data, 1000)
# 使用 SOM
best_match = som.winner([0.5, 0.4, 0.3])
这段代码首先从 minisom
导入了 MiniSom
类,然后创建了一个 SOM 实例,并进行训练。之后可以使用训练好的模型对新的输入数据进行处理。
3. 项目的配置文件介绍
setup.cfg
文件用于指导 Python 的 setuptools
工具构建和打包项目。以下是一些关键配置项的说明:
[metadata]
name = minisom
version = 2.3.2
author = Giuseppe Vettigli
author_email = giuseppe.vettigli@gmail.com
description = MiniSom - A minimalistic implementation of the Self Organizing Maps (SOM)
long_description = file: README.md
long_description_content_type = text/markdown
url = https://github.com/JustGlowing/minisom
keywords = self organizing map, SOM, artificial neural network, machine learning, numpy
classifiers =
Development Status :: 5 - Production/Stable
Intended Audience :: Science/Research
License :: OSI Approved :: MIT License
Programming Language :: Python :: 3
Topic :: Scientific/Engineering :: Artificial Intelligence
[options]
packages = find:
install_requires =
numpy >= 1.13.3
[options.extras_require]
test =
pytest
pytest-cov
pycodestyle
这个配置文件定义了项目的元数据,如名称、版本、作者等。它还指定了项目的包名和依赖,以及测试所需的额外库。例如,项目要求至少版本为 1.13.3
的 numpy
作为其依赖。extras_require
部分列出了运行测试时需要的额外库,如 pytest
和 pycodestyle
。