MedSeg 开源项目使用教程

MedSeg 开源项目使用教程

medSegMedical Image Segmentation Toolkit based on PaddlePaddle - 基于paddle的医学影像分割框架项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/me/medSeg

1. 项目的目录结构及介绍

MedSeg 项目的目录结构如下：

medSeg/
├── data/
├── medseg/
│   ├── ckpt/
│   ├── utils/
│   ├── run.py
│   ├── setup.py
│   └── ...
├── README.md
├── LICENSE
└── ...

目录结构介绍

• data/: 存放项目所需的数据文件。
• medseg/: 核心代码目录，包含模型、工具和运行脚本。
  • ckpt/: 存放预训练的模型权重文件。
  • utils/: 包含各种辅助工具和函数。
  • run.py: 项目的启动文件。
  • setup.py: 项目的配置和安装脚本。
• README.md: 项目说明文档。
• LICENSE: 项目许可证。

2. 项目的启动文件介绍

run.py

run.py 是 MedSeg 项目的启动文件，负责加载配置、初始化模型和执行分割任务。以下是 run.py 的主要功能：

• 加载配置文件。
• 初始化模型。
• 读取输入数据。
• 执行分割任务。
• 输出分割结果。

使用方法：

python run.py --input_folder path/to/input --output_folder path/to/output

3. 项目的配置文件介绍

setup.py

setup.py 是 MedSeg 项目的配置和安装脚本。它负责安装项目所需的依赖项，并提供命令行接口来运行项目。

主要功能：

• 安装依赖项。
• 提供命令行接口。

使用方法：

pip install .

配置文件

MedSeg 项目还包含一些配置文件，用于指定模型参数、数据路径等。这些配置文件通常位于 medseg/ 目录下，并以 .yaml 或 .json 格式存储。

示例配置文件：

model:
  name: EfficientDet
  weights: ckpt/efficientdet_weights.ckpt
data:
  input_folder: path/to/input
  output_folder: path/to/output

通过修改这些配置文件，可以自定义项目的运行参数。

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以上是 MedSeg 开源项目的使用教程，涵盖了项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些内容能帮助你更好地理解和使用 MedSeg 项目。

medSegMedical Image Segmentation Toolkit based on PaddlePaddle - 基于paddle的医学影像分割框架项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/me/medSeg