Ribbon 项目使用教程
ribbon Ribbon diagrams of proteins in #golang. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ribbo/ribbon
1. 项目的目录结构及介绍
Ribbon 项目的目录结构如下:
ribbon/
├── cmd/
│ ├── pdb/
│ └── ribbon/
├── scripts/
├── .gitignore
├── LICENSE.md
├── README.md
目录结构介绍:
-
cmd/: 包含项目的命令行工具代码。
- pdb/: 处理 PDB 文件的代码。
- ribbon/: 生成蛋白质带状图的代码。
-
scripts/: 包含一些辅助脚本。
-
.gitignore: Git 忽略文件配置。
-
LICENSE.md: 项目许可证文件,采用 MIT 许可证。
-
README.md: 项目介绍和使用说明。
2. 项目的启动文件介绍
Ribbon 项目的启动文件位于 cmd/ribbon/
目录下。主要的启动文件是 main.go
,它负责解析 PDB 文件并生成蛋白质的带状图。
启动文件介绍:
- main.go: 这是项目的入口文件,负责调用
pdb
包解析 PDB 文件,并使用ribbon
包生成带状图。
3. 项目的配置文件介绍
Ribbon 项目没有传统的配置文件,所有的配置都是通过命令行参数传递的。例如,使用 rcsb
命令时,可以通过参数指定 PDB 文件的 ID 和其他选项。
配置文件介绍:
- 命令行参数: 项目通过命令行参数进行配置,例如:
这里的$ rcsb 4hhb # 生成 4hhb.png 和 4hhb.stl
4hhb
是 PDB 文件的 ID,项目会自动下载对应的 PDB 文件并生成带状图。
通过以上步骤,您可以成功启动和配置 Ribbon 项目,生成蛋白质的带状图。
ribbon Ribbon diagrams of proteins in #golang. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ribbo/ribbon