MC-Net 使用教程

MC-Net 使用教程

MC-NetOfficial Code for our MedIA paper "Mutual Consistency Learning for Semi-supervised Medical Image Segmentation"项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mc/MC-Net

项目概述

MC-Net 是一个用于半监督医学图像分割的方法，其官方代码托管在 GitHub 上。该库支持基于互斥一致性学习的模型训练，特别适用于左心房等医疗图像的自动分割任务。本教程旨在指导用户如何设置环境、理解项目结构、配置文件以及如何运行此项目。

1. 项目目录结构及介绍

MC-Net 的项目结构清晰，便于开发者快速上手：

MC-Net/
├── code/                # 核心代码文件夹
│   ├── train_mcnet_2d.sh    # 2D模型训练脚本
│   ├── train_mcnet_3d.sh    # 3D模型训练脚本
│   └── ...                 # 其他训练与测试相关脚本
├── data/                # 数据存放目录
├── model/               # 模型定义和预训练权重
│   └── pretrained_pth/     # 预训练模型路径
├── LICENSE               # 许可证文件
├── README.md             # 项目说明文档
└── ...

• code 目录包含了主要的训练和测试脚本，其中.sh文件是用于执行不同模式下的训练。
• data 用于存放训练和测试的数据集，用户需要将数据按要求放置于此。
• model 包含模型定义文件和可能存在的预训练权重，这对于快速验证或迁移学习至关重要。
• LICENSE 和 README.md 分别提供了软件使用的法律许可和基本项目介绍。

2. 项目的启动文件介绍

训练模型

项目提供的两个关键脚本用于训练模型，分别是 train_mcnet_2d.sh 和 train_mcnet_3d.sh。以 train_mcnet_3d.sh 为例，它是为了训练3D模型而设计的。用户可以通过编辑此脚本来更改不同的参数，如数据集名称(--dataset_name)、模型版本(--model)、标签数量(--labelnum)等，然后通过命令行运行脚本开始训练。

测试模型

虽然直接的测试脚本没有在介绍中明确指出，但可以推断存在类似于训练脚本的测试流程，通常涉及调用特定的Python脚本（例如 test_3d.py），同样需传入相应的配置参数来加载模型并进行评估。

3. 项目的配置文件介绍

项目虽未明确提及独立的配置文件（如 .ini 或 YAML 文件），但配置通过脚本内的参数设定实现。这意味着用户需要直接在如 train_mcnet_3d.sh 脚本中调整参数来定制化配置。重要配置包括但不限于模型类型、训练集标签数量、GPU选择、温度参数等。这种配置方式简单直观，适合快速实验调整。

实际操作步骤简述

1. 克隆仓库:

   git clone https://github.com/ycwu1997/MC-Net.git
   

2. 准备数据: 将你的数据正确放置于 data 目录下。
3. 训练模型: 进入项目根目录，根据需求修改训练脚本参数后执行，例如：

   cd MC-Net
   bash code/train_mcnet_3d.sh
   

4. 测试模型: 类似地，调整并执行测试相关的命令。

以上步骤为使用MC-Net的基本流程，确保在进行任何实际操作前阅读README.md文件中的详细指南和注意事项。

MC-NetOfficial Code for our MedIA paper "Mutual Consistency Learning for Semi-supervised Medical Image Segmentation"项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mc/MC-Net