MC-Net 使用教程
项目概述
MC-Net 是一个用于半监督医学图像分割的方法,其官方代码托管在 GitHub 上。该库支持基于互斥一致性学习的模型训练,特别适用于左心房等医疗图像的自动分割任务。本教程旨在指导用户如何设置环境、理解项目结构、配置文件以及如何运行此项目。
1. 项目目录结构及介绍
MC-Net 的项目结构清晰,便于开发者快速上手:
MC-Net/
├── code/ # 核心代码文件夹
│ ├── train_mcnet_2d.sh # 2D模型训练脚本
│ ├── train_mcnet_3d.sh # 3D模型训练脚本
│ └── ... # 其他训练与测试相关脚本
├── data/ # 数据存放目录
├── model/ # 模型定义和预训练权重
│ └── pretrained_pth/ # 预训练模型路径
├── LICENSE # 许可证文件
├── README.md # 项目说明文档
└── ...
- code 目录包含了主要的训练和测试脚本,其中
.sh
文件是用于执行不同模式下的训练。 - data 用于存放训练和测试的数据集,用户需要将数据按要求放置于此。
- model 包含模型定义文件和可能存在的预训练权重,这对于快速验证或迁移学习至关重要。
- LICENSE 和 README.md 分别提供了软件使用的法律许可和基本项目介绍。
2. 项目的启动文件介绍
训练模型
项目提供的两个关键脚本用于训练模型,分别是 train_mcnet_2d.sh
和 train_mcnet_3d.sh
。以 train_mcnet_3d.sh
为例,它是为了训练3D模型而设计的。用户可以通过编辑此脚本来更改不同的参数,如数据集名称(--dataset_name
)、模型版本(--model
)、标签数量(--labelnum
)等,然后通过命令行运行脚本开始训练。
测试模型
虽然直接的测试脚本没有在介绍中明确指出,但可以推断存在类似于训练脚本的测试流程,通常涉及调用特定的Python脚本(例如 test_3d.py
),同样需传入相应的配置参数来加载模型并进行评估。
3. 项目的配置文件介绍
项目虽未明确提及独立的配置文件(如 .ini
或 YAML 文件),但配置通过脚本内的参数设定实现。这意味着用户需要直接在如 train_mcnet_3d.sh
脚本中调整参数来定制化配置。重要配置包括但不限于模型类型、训练集标签数量、GPU选择、温度参数等。这种配置方式简单直观,适合快速实验调整。
实际操作步骤简述
- 克隆仓库:
git clone https://github.com/ycwu1997/MC-Net.git
- 准备数据: 将你的数据正确放置于
data
目录下。 - 训练模型: 进入项目根目录,根据需求修改训练脚本参数后执行,例如:
cd MC-Net bash code/train_mcnet_3d.sh
- 测试模型: 类似地,调整并执行测试相关的命令。
以上步骤为使用MC-Net的基本流程,确保在进行任何实际操作前阅读README.md
文件中的详细指南和注意事项。