KG-RAG 开源项目使用指南
KG_RAG项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/kg/KG_RAG
项目介绍
KG-RAG(Knowledge Graph-based Retrieval Augmented Generation)是一个任务无关的框架,它结合了知识图谱(KG)的显式知识和大型语言模型(LLM)的隐式知识。该项目主要利用一个名为SPOKE的大型生物医学知识图谱,该图谱整合了40多个来自不同领域的生物医学知识库,专注于生物医学概念如基因、蛋白质、药物、化合物、疾病及其已建立的联系。
项目快速启动
步骤1:克隆仓库
首先,克隆KG-RAG的GitHub仓库到本地:
git clone https://github.com/BaranziniLab/KG_RAG.git
步骤2:创建虚拟环境
进入项目目录并创建一个虚拟环境:
cd KG_RAG
conda create -n kg_rag python=3.10.9
conda activate kg_rag
步骤3:安装依赖
安装项目所需的所有依赖:
pip install -r requirements.txt
步骤4:更新配置文件
编辑config.yaml
文件,确保所有必要信息已正确填写。
步骤5:运行设置脚本
运行设置脚本以初始化项目:
python -m kg_rag run_setup
步骤6:运行KG-RAG
从终端运行KG-RAG:
python -m kg_rag rag_based_generation GPT text_generation -g <your_favorite_gpt_model>
应用案例和最佳实践
KG-RAG在生物医学领域有广泛的应用,特别是在需要高精度内容的场景中。例如,通过结合知识图谱,KG-RAG能够提供关于FDA批准药物的准确信息,这在药物研发和医疗决策支持系统中非常有用。
典型生态项目
KG-RAG作为一个开源项目,其生态系统中包含多个相关的项目和工具,例如:
- SPOKE:一个大型生物医学知识图谱,为KG-RAG提供生物医学上下文。
- GPT-4 和 GPT-3.5-turbo:用于文本生成的大型语言模型,与KG-RAG结合使用以提高生成内容的质量。
通过这些工具和项目的结合使用,可以进一步增强KG-RAG在特定领域的应用效果和实用性。