msprime 项目教程
1. 项目的目录结构及介绍
msprime 项目的目录结构如下:
msprime/
├── msprime/
│ ├── __init__.py
│ ├── cli.py
│ ├── demographic_models.py
│ ├── mutations.py
│ ├── sim_ancestry.py
│ ├── sim_mutations.py
│ ├── ...
├── tests/
│ ├── test_ancestry.py
│ ├── test_mutations.py
│ ├── ...
├── docs/
│ ├── index.rst
│ ├── installation.rst
│ ├── ...
├── README.md
├── LICENSE
├── pyproject.toml
├── setup.py
└── ...
目录结构介绍:
msprime/
: 包含项目的主要代码文件,如__init__.py
、cli.py
、demographic_models.py
等。tests/
: 包含项目的测试文件,如test_ancestry.py
、test_mutations.py
等。docs/
: 包含项目的文档文件,如index.rst
、installation.rst
等。README.md
: 项目的介绍文件。LICENSE
: 项目的许可证文件。pyproject.toml
和setup.py
: 项目的配置文件。
2. 项目的启动文件介绍
msprime 项目的启动文件主要是 msprime/__init__.py
和 msprime/cli.py
。
msprime/__init__.py
这是 msprime 包的初始化文件,包含了项目的核心功能和 API 的导入。
msprime/cli.py
这是 msprime 的命令行接口文件,用户可以通过命令行运行 msprime 的模拟功能。
3. 项目的配置文件介绍
msprime 项目的配置文件主要包括 pyproject.toml
和 setup.py
。
pyproject.toml
这是一个标准的 Python 项目配置文件,用于定义项目的依赖、构建工具和其他元数据。
setup.py
这是一个传统的 Python 项目配置文件,用于定义项目的安装和分发信息。
通过这些配置文件,用户可以轻松地安装和配置 msprime 项目。