HDBSCAN 深度学习聚类库安装与使用教程

HDBSCAN 深度学习聚类库安装与使用教程

hdbscan项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/hd/hdbscan

1. 项目目录结构及介绍

HDBSCAN 是一个高性能的实现 Hierarchical Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise（层次密度基空间聚类应用噪声）算法的 Python 库。其仓库的目录结构大致如下：

.
├── CHANGES.md                # 更新日志
├── CONTRIBUTING.md           # 贡献指南
├── docs                       # 文档源码
│   ├── Makefile               # 文档构建脚本
│   └── ...                    # 其他文档相关文件
├── examples                   # 示例代码
│   └── ...                    # 不同示例脚本
├── hdbscan                    # 主要源代码
│   ├── __init__.py            # 包初始化
│   ├── cluster.py             # 聚类算法实现
│   ├── utilities.py           # 辅助工具函数
│   └── ...                    # 其他模块
├── LICENSE.txt                # 许可证文件
├── MANIFEST.in                # 包含在发布中的文件列表
└── setup.py                   # 安装脚本

这个结构中，docs 目录包含了项目的文档，examples 存放了使用示例，而 hdbscan 则是核心算法的实现。

2. 项目的启动文件介绍

setup.py 文件是 Python 中标准的打包和安装脚本。你可以通过运行此脚本来安装 HDBSCAN 库。以下是 setup.py 的主要部分，用于定义项目元数据和包依赖：

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name="hdbscan",
    version="0.8.1",  # 实际版本号可能不同
    description="Hierarchical Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise.",
    author="Leland McInnes",
    author_email="leland.mcinnes@gmail.com",
    url="http://github.com/scikit-learn-contrib/hdbscan",
    classifiers=[
        ...
    ],
    packages=find_packages(),
    install_requires=["scipy>=0.17.0", "numpy>=1.8.2"],
)

执行 python setup.py install 将安装 HDBSCAN 及其依赖到你的环境中。

3. 项目的配置文件介绍

HDBSCAN 并没有提供特定的配置文件，它的参数通常是通过 API 在代码中设置的，例如在创建 hdbscan.HDBSCAN 对象时传递参数。例如：

import hdbscan

clusterer = hdbscan.HDBSCAN(min_cluster_size=10, min_samples=5)
clusterer.fit(X)

在这个例子中，min_cluster_size 和 min_samples 分别是设定最小簇大小和最小样本数的参数。其他的配置可以通过查看官方文档或源代码来了解。

要在实际使用中调整 HDBSCAN 的行为，通常是在实例化对象时指定这些参数，或者在运行时通过方法调用来更改。例如，可以使用 branch_detection_data=True 来启用分支检测功能。

请注意，如果你打算进行大规模的数据处理或对性能有特殊要求，你可能还需要调整计算环境的配置，如内存限制、并行计算设置等，而不是修改项目内部的配置文件。

hdbscan项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/hd/hdbscan