Buzsaki Lab 项目使用教程

Buzsaki Lab 项目使用教程

buzcode Code for internal lab sharing - polishing has started but is by no means complete 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/bu/buzcode

1. 项目的目录结构及介绍

Buzsaki Lab 项目的目录结构如下：

buzcode/
├── GUITools/
├── analysis/
├── database/
├── detectors/
├── docs/
├── externalPackages/
├── generalComputation/
├── io/
├── preprocessing/
├── tutorials/
├── utilities/
├── visualization/
├── .gitignore
├── Contents.m
├── LICENSE
├── compileBuzcode.m
└── readme.txt

目录介绍：

• GUITools: 包含与图形用户界面相关的工具和函数。
• analysis: 包含数据分析相关的函数和脚本。
• database: 包含数据库相关的函数和脚本。
• detectors: 包含用于检测特定事件（如神经元活动）的函数和脚本。
• docs: 包含项目的文档文件。
• externalPackages: 包含外部依赖包。
• generalComputation: 包含通用计算相关的函数和脚本。
• io: 包含输入输出相关的函数和脚本。
• preprocessing: 包含数据预处理相关的函数和脚本。
• tutorials: 包含项目的教程文件。
• utilities: 包含实用工具函数和脚本。
• visualization: 包含数据可视化相关的函数和脚本。
• .gitignore: Git 忽略文件配置。
• Contents.m: MATLAB 包的入口文件。
• LICENSE: 项目的开源许可证文件。
• compileBuzcode.m: 项目的编译脚本。
• readme.txt: 项目的介绍文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 compileBuzcode.m。该文件用于编译和初始化 Buzsaki Lab 项目。

使用方法：

1. 打开 MATLAB。
2. 导航到项目根目录。
3. 运行 compileBuzcode.m 脚本。

% 示例代码
run('compileBuzcode.m');

3. 项目的配置文件介绍

项目中没有明确的配置文件，但可以通过修改 readme.txt 文件中的数据格式标准来调整项目的配置。

数据格式标准：

所有文件将遵循单一的（灵活但有文档记录的）数据库结构。所有与单个记录相关的文件将存放在一个自包含的文件夹中，或一个“basePath”（例如 whateverPath/baseName/），其中 baseName 是记录的名称。

文件命名遵循以下约定：

basePath/baseName.fileName.filetype

例如：

/recording7/recording7.ripples.events.mat

该文件包含有关名为 recording7 的记录中的涟漪信息，其内容将采用 events.mat 类型文件的格式。

更多关于数据格式标准的信息可以在项目的 Wiki 中找到：Data Formatting Standards。

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通过以上步骤，您可以顺利地开始使用 Buzsaki Lab 项目。

buzcode Code for internal lab sharing - polishing has started but is by no means complete 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/bu/buzcode