PaDELPy: 一个用于分子描述符计算的Python封装库

PaDELPy: 一个用于分子描述符计算的Python封装库

padelpy A Python wrapper for PaDEL-Descriptor software 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pa/padelpy

项目基础介绍和主要编程语言

PaDELPy 是一个用于分子描述符计算的Python封装库，它提供了对 PaDEL-Descriptor 软件的Python接口。PaDEL-Descriptor 是一个广泛使用的分子描述符计算工具，而 PaDELPy 则允许用户通过Python直接访问 PaDEL-Descriptor 的命令行接口。该项目的主要编程语言是 Python。

项目核心功能

PaDELPy 的核心功能包括：

1. 分子描述符计算：支持从 SMILES 字符串、MDL MolFile 和 SDF 文件中计算分子描述符。
2. 指纹计算：可以计算分子的指纹，包括 PubChem 指纹。
3. 多线程支持：允许用户设置计算描述符和指纹时使用的线程数，以提高计算效率。
4. 命令行接口封装：提供了一个命令行接口封装函数，允许用户通过 Python 调用 PaDEL-Descriptor 的任何功能。
5. 结果输出：支持将计算结果保存为 CSV 文件。

项目最近更新的功能

根据最新的更新记录，PaDELPy 最近更新的功能包括：

1. 多线程优化：增加了对多线程计算的支持，用户可以通过设置 threads 参数来控制使用的线程数。
2. 指纹计算增强：增加了对 PubChem 指纹的计算支持，用户可以通过设置 fingerprints=True 来启用指纹计算。
3. 结果保存功能：新增了将计算结果保存为 CSV 文件的功能，用户可以通过设置 output_csv 参数来指定输出文件路径。
4. 命令行接口扩展：扩展了命令行接口封装函数，支持更多的 PaDEL-Descriptor 参数，如 detectaromaticity、removesalt 等。

通过这些更新，PaDELPy 提供了更强大的功能和更高的灵活性，使得用户能够更方便地进行分子描述符和指纹的计算。

padelpy A Python wrapper for PaDEL-Descriptor software 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pa/padelpy