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原创 python/perl操作.ini配置文件

python操作.ini配置文件.ini配置文件python生成ini文件python读取ini文件perl 读取ini风格配置文件.ini配置文件ini文件: 这个在windows下用的比较多,只支持一层参数,太复杂的项目就不适用了1. 后缀一般为 .ini .cfg .config .txt2. 格式由:节、键、值组成。(1)节 数据段的段名,用中括号包裹(2)键-值对通用参数(DEFAULT)[DEFAULT]此小结下的变量在所有小节中均可使用python生成ini文

2021-05-28 15:50:35 333

原创 YAML配置文件及python yaml包

python使用YAML配置文件YAML文件说明语法说明python读取YAMLYAML文件结构示例及对应python数据结构1. 简单一维2. 二维3. 复合结构1(列表和对象)4. 复合结构2(列表和对象)5. 引用(& *)YAML基本变量1. 字符串2. 布尔值3. 整数4. 浮点数5. Null6. 时间7. 日期示例:YAML文件说明通俗易懂对齐和空格要注意,有点像Python的语法语法说明大小写敏感缩进代表层级关系(类似python)缩进空格数量不重要,但同一等级数

2021-05-28 11:25:24 408

原创 python生成器

生成器优势1. 节省内存2. 其可中断函数循环做些其他事情,同时记住足够的数据随时继续函数循环创建1. 生成器表达式列表生成式 [ ] 换成 ( ) 即可>>> a = [i for i in range(10)]>>> a[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]>>> a = (i for i in range(10))>>> a<generator object <genexp

2021-02-03 15:06:10 97

原创 bash字符串截取、匹配

目录截取字符串1. 指定字符匹配字符串2. 指定位置截取字符串匹配特定起始/结尾/子串1. 比较 ==2. 正则匹配截取字符串1. 指定字符匹配字符串# 去左留右, % 去右留左,不匹配则保留整个字符串$ string='A/a/b/c/d/D'$ echo ${string#*/}a/b/c/d/D$ echo ${string##*/}D$ echo ${string%/*}A/a/b/c/d$ echo ${string%%/*}A$ echo ${string%%a/*}

2021-02-03 14:08:58 2107

原创 文件操作-选取指定行

获取前N行head -n 10 test.txtsed -n '1,10p' test.txtawk 'FNR<11' test.txt获取文件最后N行tail -n 10 test.txt获取第N行到文件末尾tail -n +10 test.txtsed -n '10,$p' test.txtawk 'FNR>9' test.txt获取指定行sed -n '10p' test.txtsed -n '10p;11q' test.txtawk 'FNR==10' t

2020-10-16 12:10:04 610

原创 python3 切片操作

列表操作>>> L = list(range(100))>>> L[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52,

2020-08-09 12:14:43 198

原创 Anaconda源配置

conda源源文件一般为 ~/.condarc增加、删除或更改源顺序都可直接更改此文件查看源列表conda config --get channels添加源conda config --add channels bioconda安装软件或者程序包查询可安装软件或包的版本conda search requests列举所有已安装软件及软件相关包conda list安...

2020-08-03 21:57:41 1633 1

原创 Ubuntu 16.04安装中文字体

这里写自定义目录标题1. 下载字体2. 导入字体文件3. 安装字体4.验证5. Office文档1. 下载字体天下字体-经典字体库也可从windows系统中拷贝已有的字体文件,Windows字体文件的一般路径为C:/Windows/Fonts2. 导入字体文件Ubuntu 系统的字体文件路径一般为 /usr/share/fonts/将获取到的字体文件拷贝到该路径下。3. 安装字体 mkfontscale mkfontdir fc-cache4.验证fc-list :lang=zh

2020-08-03 20:13:29 1494

原创 QIIME 2 安装(使用conda 安装linux版本)

下载qiime2所需安装软件列表wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2020.6-py36-linux-conda.yml创建环境conda env create -n qiime2-2020.6 --file qiime2-2020.6-py36-linux-conda.yml激活环境conda activate qiime2测试qiime info结果展示:关闭环境conda deactivate...

2020-07-13 10:38:50 2535

原创 Ubuntu安装jdk11

下载JDK11下载路径解压后将路径添加到系统PATH中即可

2020-04-21 09:28:33 709

原创 conda环境基本操作

conda基本操作anaconda安装及更新安装更新查看conda信息conda环境基本操作查看所有conda环境创建和删除环境激活和关闭环境重命名环境conda源源文件查看源列表添加源安装软件或者程序包查询可安装软件或包的版本列举所有已安装软件及软件相关包安装及移除软件或者包anaconda安装及更新安装Linux下安装指导(最新版)历史版本下载更新conda update cond...

2020-04-15 11:36:53 973 1

原创 Ubuntu16.04启动问题-root filesystem on * requires a manual fsck

详细描述Ubuntu16.04笔记本强制关机后,再开机出现文件系统错误,无法正常启动,具体描述如下:dev/sda1: Inodes that were part of a corrupted orphan linked list found./dev/sda1: UNEXPECTED INCONSISTENCY:; RUN fsck MANUALLY (i.e., witho...

2020-04-04 16:52:41 1174 2

原创 R语言-安装bioconductor

运行环境及版本R v3.6.1bioconductor v3.10安装bioconductorif (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")BiocManager::install()查找R包BiocManager::available() ...

2020-03-13 12:25:29 3138

原创 R语言使用getopt读取命令行参数

#!/usr/bin/Rscript# _*_ coding: utf-8 _*_library('getopt') command=matrix(c( 'help', 'h', 0,'loical', '显示此帮助信息', 'input', 'i', 2, 'character', '输入文件', 'output', 'o', 1, 'character', '...

2020-03-13 10:45:04 1005

原创 机器学习基础

数据挖掘十大算法C4.5决策树/K-均值/支持向量机/Apriori/最大期望算法/PageRank算法/AdaBoost算法/K-近邻算法/朴素贝叶斯算法/分类回归树算法机器学习简单的说,机器学习就是把无序的数据转换成有用的信息,利用计算机彰显数据背后的真实含义日常应用人脸识别/手写识别/垃圾邮件过滤/购物网站的产品推荐等相关术语以创建一个可识别鸟类的专家系统为例.选取4种不同的...

2020-02-27 17:01:08 198

原创 ubuntu 16.04安装pycharm

官网上提供的Ubuntu16.04及之后版本可直接使用的命令行安装方式.下载地址sudo snap install pycharm-community --classic

2019-12-24 07:55:17 64

原创 Ubuntu16.04安装python3.6

Ubuntu 16.04 默认安装的python版本位 python2.7 和 python3.5,我在安装 anoconda 时选择的时 python3.7 版本的,因此我的系统中目前存在 python2.7,python3.5 和 python3.7 三个版本的python.本来打算将 python3.5 卸载掉然后再安装 python3.6 的,但是卸载后已经打开的一些应用还在工作,比如终...

2019-12-22 23:13:34 88

原创 Ubuntu16.04安装anaconda

conda 安装说明文档1.下载anacondaanaconda下载页面2.安装bash Anaconda-latest-Linux-x86_64.sh3.安装参数根据提示操作:同意安装协议选择安装位置(默认位置)同意初始化(此步骤更改~/.bashrc文件,将anaconda路径添加到环境变量PATH中)4.验证重新打开终端,运行conda list,得到一系列安装的...

2019-12-22 19:14:35 189

原创 Ubuntu16.04安装git

简单使用以下命令即可.sudo apt-get install git

2019-12-22 09:43:54 153

原创 mysql-从外部向表格导入数据时常见警告信息

查看警告信息show warnings;警告信息类型一字段给定长度不够Warning | 1265 | Data truncated for column '刊名' at row 1265类型二字符集| Warning | 1366 | Incorrect string value: '\xB5\xDA\xB6\xFE\xBD\xEC...' for column '刊名' a...

2019-12-21 22:41:14 507

原创 Ubuntu16.04 安装时遇到的问题--启动(grub)

问题描述U盘安装Ubuntu16.04系统后,重启时系统进入grub或者grub rescue命令行模式,无法进入图形界面.原因一般是系统分区出现了问题,启动时找不到引导文件(grub.cfg)或者还有一些其他文件,比如normal.mod.本人出现此问题是因为重装系统时更换了系统盘,启动时系统查找的第一位置仍是原先的盘,而非新换的盘,故此需要将系统中记录的盘更改.对于网上提供的许多直接...

2019-12-21 22:31:22 1121

原创 U盘安装Ubuntu16.04

安装Ubuntu16.04系统镜像启动盘制作工具启动盘制作安装系统镜像Ubuntu16.04桌面版(64位)下载地址启动盘制作工具windows下制作Ubuntu启动盘Universal USB Installer启动盘制作安装将U盘插入电脑启动时选择try without install点击安装盘,按照指示一步步操作即可....

2019-12-21 21:51:06 238

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