sparse matrix 存储

由于sparse matrix的特殊性,在存储的时候,一般情况下吃用CSR(Compressed Sparse Row)这种format来实现。通过使用3个数组来描述一个Sparse Matrix.

double* mValues; // 保存Sparse Matrix 非0的值。

int* mColumnIds; //保存column ID

int* mRowIds; //保存各行第一个非零value在mColumnIds的位置。

使用类来描述这个Sparse Matrix,可以这样:

class CMatrix

{

protected:

       double* mValues;

       int*       mColumnIds;

       int*       mRowIds;  

      int          mNoRows; //有多少行。

};

通过每行来遍历这个sparse matrix:

for(int i = 0; i < mNoRows; i++)

{

         for(int j = mColumnIds[i]; j < mColumnIds[i + 1]; ++j)

         {

                   //mValues[i * mNoRows + j] = .....      //第i行第j列的值。

         }

}


CSR是最常用的一种,这种方式可以很方便使用OpenMP,CUDA, OpenCL来进行并行计算。

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