PyWebIO 简单的Sanger截图应用

功能：是为了让部门同事，通过内网，以及指定位置，进行sanger截图。

原sanger图：

想要的sanger图：
 

运行的目录如下：

 

网站的初始界面如下： 

点击"分析"：

 

源代码如下：

 

#!/bin/env python
#coding=utf-8
import pywebio
import pywebio.output as output
import pywebio.input as input
import pywebio.pin as pin
from pywebio.session import hold
from pywebio import start_server
import os
import glob
os.chdir("/share_data/clin_result/clin_epilepsy_result/Sanger/PyWebIO_Sanger")   #分析目录


def get_ab1_list():
    ab1List = glob.glob("*ab1")
    return ab1List                                    #返回该目录下的所有ab1后缀文件

def get_sanger():                       #主程序
    ab1List = get_ab1_list()
    print(ab1List)
    pin.put_select("ab1",label="请选择ab1文件：",options=ab1List)                       #选项列表，单选，不支持多选，因为不同的sanger，想要截取的位置不一样。
    pin.put_input("pos",label="请输入想要截取的图片位置",type=input.NUMBER)              #突变的位置。
    #pin.put_input("outName",label="请输入结果图片的名字")
    
    def cut():
        ab1Name = pin.pin["ab1"]
        pos = pin.pin["pos"]
        aList = ab1Name.split("-")
        outName = aList[1]+"_"+aList[2]+"-"+aList[4]+'_'+aList[5].split("_")[0]+'.png'   #输出文件名称。
        os.system("/usr/bin/Rscript sangerLocalPosPlot_linux_pywebio.R {} {} {}".format(ab1Name, pos, outName))      #核心是这一步，运行sanger截图的R
        output.put_image(open(outName,'rb').read())                                     # 输出运行出来的图片
        
    output.put_buttons(["分析"], lambda _:cut())                        #点“分析”时，运行上面的程序
    
    hold()
    
if __name__ == '__main__':
    start_server(get_sanger,port=8083)          #启动服务
    #get_sanger()