关于caffe, matlab, opencv, anaconda和CUDA安装总结

走过的坑都不会白走的，及时记录，总结反思；

这几天总是在caffe安装编译中反复纠缠，无谓消耗时间，简单记录，以未来借鉴。
参考文章：
https://blog.csdn.net/babytang008/article/details/78631776
https://blog.csdn.net/oppo62258801/article/details/60333355

安装重点步骤

• 显卡驱动官网查询确认后安装，使用runfile，禁用noueav，安装时加入–no-opengl
• CUDA安装时不需要额外装驱动，安装完记得测试
• opencv安装使用cmake-gui简单些，安装时出错重新再来几篇就行
• caffe安装坑很多，从makefile.config的配置，makefile的修改，链接库的添加，anaconda的冲突等都会出现
• matcaffe编译和mattest容易出错，重点在于，matlab中软连接库（libstdc++,libopencv库都需要指向系统库）备份后重新生成

记录caffe和matlab常出现错误和解决方法

Problem1.

caffe installation : opencv libpng16.so.16 linkage issues

method:
cd /usr/lib/x86_64-linux-gnu
sudo ln -s ~/anaconda/lib/libpng16.so.16 libpng16.so.16
sudo ldconfig

Probelm2.

make all -j4make过程中出现找不到lhdf5_hl和lhdf5的错误

解决方案：
在计算机中搜索libhdf5_serial.so.10.1.0，找到后右键点击打开项目位置
该目录下空白处右键点击在终端打开，打开新终端输入
sudo ln libhdf5_serial.so.10.1.0 libhdf5.so
sudo ln libhdf5_serial_hl.so.10.0.2 libhdf5_hl.so
最后在终端输入sudo ldconfig使链接生效
原终端中输入make clean清除第一次编译结果
再次输入make all -j4重新编译

Problem3.

问题 usr/include/boost/python/detail/wrap_python.hpp:50:23: fatal error: pyconfig.h: No such file or directory

解决方案
$make clean
$export CPLUS_INCLUDE_PATH=/usr/include/python2.7
$make all -j8
原因:
python路径都改为了anaconda的路径，但是CPLUS的path没有设置，系统中我也没把anaconda设置成默认的python导致的。

Problem4.

系统：ubuntu11.04出现error while loading shared libraries: libjpeg.so.8，这主要是程序无法找到动态链接库！！

解决的方法之一：把你安装的 libjpeg 库下的 libjpeg* 链接到 /usr/lib。
命令如下：ln -s 你的libjpeg库的安装目录/libjpeg*   /usr/lib
比如，我的 libjpeg 库安装在 /root/tmp/jpeg 下，则所用命令为：ln  -s   /root/tmp/jpeg/libjpeg*    /usr/lib
之后再运行你的程序，应该就没问题了。
注：我的系统是开启了root 用户的，所以命令在运行时没有加 sudo，其他人则视情况而定。

关于caffe编译出现libcaffe.so问题的，可能是protobuff，解决方法：
https://blog.csdn.net/e01528/article/details/79532462

Problem5:

错误描述：如上图显示，未定义的引用“TIFFReadRGBAStrip@LIBTIFF_4.0”，说明是libtiff库未指明，

解决办法：执行下面命令操作查找对应库路径，并添加

$ldconfig -p|grep libtiff #这个指令是查找库索引

$ export LD_LIBRARY_PATH=/lib/x86_64-linux-gnu/ #这个指令是将路径添加至配置文件中

然后再编译make all,就可以继续进行下面测试了。

$make clean # 清理上次编译错误记录

$make all -j8

Problem6:

linux下Matcaffe调用及库链接问题的解决（mattest不通过）

Problem6-1：

MEX-file,’/home/flyingbird/Downloads/caffe-master/matlab/+caffe/private/caffe_.mexa64’无效:

/home/flyingbird/Downloads/caffe-master/matlab/+caffe/private/caffe_.mexa64:
undefined symbol:
_ZN2cv8imencodeERKNSt7__cxx1112basic_stringIcSt11char_traitsIcESaIcEEERKNS_11_InputArrayERSt6vectorIhSaIhEERKSB_IiSaIiEE。

出错 caffe.set_mode_cpu (line 5)
caffe_(‘set_mode_cpu’);

出错 caffe.run_tests (line 6)
caffe.set_mode_cpu();

6-1 解决方法：

具体的方法基本思想是找到matlab和caffe所依赖的这些库的位置，然后通过某种方式建立连接即可。
1 找到matlab中这些库的位置
libstdc++.so.6：它在matlab中的位置时 matlab/sys/os/glnxa64/中
libopencv_core.so.2.4，libopencv_highgui.so.2.4，libopencv_imgproc.so.2.4：matlab/bin/glnxa64中
而且通过ls libopencv_* -l 命令可以看到这些库通过链接的都是这个文件夹中自己的库。
2 找到caffe所依赖的这些库的位置
这四个库资源都是在：/usr/lib/x86_64-linux-gnu中
3 进行链接
1）首先需要备份或删除matlab中的那几个库的软链接，建议备份，命令如下：
Sudo mv /home/xaver/local/MATLAB/sys/os/glnxa64/ libstdc++.so.6 /home/xaver/local/MATLAB/sys/os/glnxa64/ libstdc++.so.6
注意以上路径并不一定就是你的路径，物理意义上表示的是你的matlab所安装的路径 

Problem6-2:编译mattest

测试下编译好的matcaffe是否能用——在这一步一般不会编译成功，这里需要修改两个领域共计四个库的链接。其原理是因为matlab与caffe通过接口进行编译的过程中，两者所引用的库应当指向同一个即可

Problem6-2解决方法：

sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_core.so.2.4 /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libopencv_core.so.2.4
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4 /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libopencv_highgui.so.2.4
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_imgproc.so.2.4 /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libopencv_imgproc.so.2.4

Problem6-3：

uname: /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
sed: /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
getconf: /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
awk: /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
awk: /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
/usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/MATLAB: /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)

Problem6-3解决方法：

编译make matcaffe后，执行make mattest后，往往出现“Invalid MEX-file"问题，其原因是MATLAB和linux的库冲突，解决的方法是用linux的库（在编译caffe之前大家的opencv等库肯定也早已装好了）

大部分的解决方法是通过export LD_LIBRARY_PATH和 LD_PRELOAD来链接，但是效果不好。最后发现，只有直接去MATLAB下面删除库并重新链接到x86_64-linux-gnu的方法是最好的。具体方法如下：

1.不需要降级gcc和g++，就用linux的自带版本，否则caffe编译不一定通过。我的是14.04的5.4（千万不要先用5去编译caffe再降级用4.4编译matcaffe）

2.不要去用改LIBRARY_PATH的方法，因为很可能不成功，尤其是有倒霉催的anaconda的情况下。

3.找到你的linux库的位置（一般是/usr/lib/x86_64-linux-gnu/)以及MATLAB库的位置（默认是/usr/local/MATLAB/R2014a/sys/os/glnxa64/）。然后写个sh执行下列操作
rm -rf /usr/local/MATLAB/R2014a/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6.0.21 /usr/local/MATLAB/R2014a/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6
rm -rf /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libopencv_core.so.2.4
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_core.so.2.4.9  /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libopencv_core.so.2.4
rm -rf /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libopencv_imgproc.so.2.4
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_imgproc.so.2.4.9  /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libopencv_imgproc.so.2.4
rm -rf /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libopencv_highgui.so.2.4
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4.9  /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libopencv_highgui.so.2.4
rm -rf /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libfreetype.so.6
ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfreetype.so.6  /usr/local/MATLAB/R2014a/bin/glnxa64/libfreetype.so.6

参考文章：https://blog.csdn.net/luanmaqianzhao/article/details/54669860
“`python

总结

耐心修改，认真调试，注意出错最后给出的提示，分析常见出错的软链接报错提示，掌握软链接使用方法，应该能解决常见问题！