Abaqus 6.14-5 安装

安装包准备

下载安装包：
链接：https://pan.baidu.com/s/1PvhSItq4ftiavBCOVv2BkA?pwd=dah3
下载完成后上传到服务器中：

解压

进入上传到的路径中，对文件进行解压操作
服务器上没有root权限无法直接mount挂载ISO文件，需要使用xorriso工具

mkdir ISO
/tmp/xorriso -osirrox on -indev ABAQUS_6.14-5_Win_Linux_x64.iso -extract / ISO

许可证安装

首先安装许可证服务

解压破解文件，解压后移动到安装路径

cp -r ~/opt/apps/cfd/abaqus/SIMULIA_ABAQUS_6.14-5_Win_Linux_x64-SSQ/_SolidSQUAD_/Linux64/simulia ~/opt/apps/cfd/abaqus/6.14/

进入破解文件路径

修改ABAQUS.lic文件，把第一行的第二个单子修改成为要作为许可证服务器的主机名，例如ln1

启动许可证服务

软件安装

进入安装文件路径，执行./ISO/setup， 并设置临时文件路径为/tmp

进入安装流程

选择安装Abaqus

设置许可证服务器端口和主机名，例如27011@ln1


设置安装路径，手动选择即可



完成后确定即可

运行

安装完成后，直接运行提示缺少libstdc++.so.5文件

这个文件属于compat-libstdc+±33.x86_64包，其中包含两个文件，新建一个路径包含这包中的文件。可以通过yum下载这两个文件

mkdir LIB

设置环境变量

export LD_LIBRARY_PATH=$PWD:$LD_LIBRARY_PATH

完成后即可

常见问题

1. 运行时无法访问许可证服务器

在集群运行时，可能由于集群配置等原因，导致无法通过DNS解析到许可证服务器，这时候建议使用IP地址作为许可证服务器的标识，只需要在安装的时候制定即可，例如27001@10.123.21.101

2. MPI 运行

支持PMPI和IMPI
设置环境变量mp_mpi_implementation=IMPI即可，或者通过site目录下的全局变量设置

例如设置其他的MPI，就把下面的设置加入到配置abaqus_v6.env中

###################################################
# OpenMPI (4.0.7)
mp_mpi_implementation=OMPI
mp_mpirun_path={OMPI: '/usr/bin/mpirun'}

3. slurm 提交脚本示例

abaqus 多节点MPI并行slurm提交脚本示例
abaqus_v6.env文件

mp_mpi_implementation=IMPI
mp_mpirun_path={IMPI: '/thfs/appsoftware/Compiler/openmpi/4.1.3/bin/mpirun'}

env.sh文件

export PATH=/thfs/home/lj/opt/apps/cfd/abaqus/6.14/simulia/Commands:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/thfs/home/lj/opt/apps/cfd/abaqus/6.14/simulia/LIB:$LD_LIBRARY_PATH

abaqus_submit.sh文件

#!/bin/env bash
#SBATCH -p u_test
#SBATCH --nodes=3       # 节点数量
#SBATCH --ntasks=12     # 每个节点任务数量
#SBATCH --job-name=abaqus_submit
#SBATCH --error=job.%J.err
#SBATCH --output=job.%J.out

source ./env.sh
abaqus mp_mode=mpi cpus=${SLURM_NTASKS} job=exa_acrotflowaxi ask_delete=OFF interactive

4. 许可证相关

Abaqus使用的许可证模型比较特殊，会根据核时签出不同数量的许可证，下面是计算公式

参考资料

https://www.linkedin.com/pulse/abaqus-openmpi-marcin-wierszycki/
https://ac.sugon.com/doc/1.0.6/11250/general-handbook/scheduler/ABAQUS-slurm.html
https://www.cnblogs.com/cutd/p/9936101.html
https://help.3ds.com/HelpProductsDS.aspx
https://hcc.unl.edu/docs/submitting_jobs/app_specific/job-examples/abaqus/abaqus6.14.2/