FEniCS学习笔记01：centos7下通过conda安装FEniCSx0.7

对于2023年版本的Fenicsx0.7，官网（https://fenicsproject.org/download/）推荐使用conda命令安装集成好的Python包，因此我们的安装思路是先安装Anaconda，再按照官网步骤安装Fenics

1.安装Anaconda

（1）前往anaconda官网https://www.anaconda.com/distribution/下载最新版的anaconda安装文件，Linux对应的文件后缀名是.sh

（2）下载完成后进入安装文件所在目录（如：/home/hpc/Download），在该目录下打开终端（也可以用cd命令进入该目录）

输入以下命令，安装anaconda：

bash Anaconda3-2023.09-0-Linux-x86_64.sh

安装过程中根据个人需要输入yes或no，其余时候一直按enter即可完成安装。

（3）安装结束后要检查环境变量是否写入

输入以下命令，查看配置文件：

sudo gedit ~/.bashrc

检查文件末尾是否有anaconda的安装路径（如下图所示则直接进行第（4）步）

 如果没有则手动添加（地址按需更改）：

export PATH="/home/xxxx/anaconda3/bin:$PATH"

更改后保存 关闭文件，在终端输入以下命令使文件生效：

source ~/.bashrc

（4）验证Anaconda安装成功

终端输入conda，无报错，出现下图信息即安装成功

2.安装FeniCS

（1）在终端输入官网代码（请登陆官方网站 https://fenicsproject.org/download/查看最新版本的安装教程）：

conda create -n fenicsx-env
conda activate fenicsx-env
conda install -c conda-forge fenics-dolfinx mpich pyvista

第一行代码：创建环境fenicsx-env（一般不会在base环境下装包，正如不会在C盘下安装软件一个道理）

第二行代码：激活（进入）环境fenicsx-env

第三行代码：指定从渠道conda-forge中获取fenics-dolfinx（Fenics正主）、mpich（高性能可移植的MPI实现，用于并行计算）和pyvista（用于3D数据可视化和网格处理的Python库）三个软件包

（2）安装中可能遇到的问题：

(a) 卡在conda solving environment这一步，大概率是conda版本过低，用以下代码解决：

conda update -n base conda

更新base环境下的conda，fenicsx-env环境的conda也会随之更新

(b) 报错

WARNING: No ICDs were found. Either,
- Install a conda package providing a OpenCL implementation (pocl, oclgrind, intel-compute-runtime, beignet) or
- Make your system-wide implementation visible by installing ocl-icd-system conda package.

应该是缺可视化的包，按提示随便选择一个安装即可，以防万一，小白博主按网上教程安装了以下三个包

conda install -c conda-forge  pocl  

conda install -c conda-forge oclgrind

conda install -c conda-forge ocl-icd-system

（3）安装fenics所需库函数，注意要在fenicsx-env环境下进行安装

终端输入以下代码：

## 安装python的各种库函数 numpy matplotlib pandas等
conda install numpy
conda install matplotlib
conda install pandas

（4）验证Fenics是否安装成功，根据官网的tutorial在终端执行第一个fenics程序https://jsdokken.com/dolfinx-tutorial/

首先在fenicsx-env环境下输入python：

然后在>>>后输入官网tutorial给的python代码：

import dolfinx
print(f"DOLFINx version: {dolfinx.__version__} based on GIT commit: {dolfinx.git_commit_hash} of https://github.com/FEniCS/dolfinx/")

回车得到以下输出：

FEniCSx0.7版本安装成功！（最后可输入exit()退出python～）

PS：Fenics本质是一个python包，如果跟博主一样之前没用过python这门语言，建议在入门fenics前先学习一下python的基础知识，下载pycharm（推荐）或者vscode编辑器便于后续调试python代码