问题一:
作者一直在bash下运行gamit, 突然有一天rinex文件转化命令无法运行“sh_crx2rnx”,报错:crx2rnx无法识别。 同样的在做基线解算实验时,调用rx2apr命令也是无法识别。
在gamit文件下查找此两个文件,是能找到的。并且bash的环境配置变量也没有问题。doy和sh_get_rinex都可以正常运行。这个问题是由于gamit的运行环境应该是csh,虽然大部分的命令在bash下也可以运行。
解决方法:此时需要切换shell(命令:csh, 取得root权限 sudo -i), 并配置正确的环境变量。
编辑好csh.cshrc以后,执行source csh.cshrc(导入吧,算是)。
之后,在csh下执行crx2rnx或rx2apr就都没问题了。
问题二:
在配置csh.cshrc时,环境变量配置有误(少了"$"),导致csh所有命令失效。切换路径,切换SHELL,编辑文件啥都不行。
解决方法:直接加命令的绝对路径如:/usr/bin/cd, /usr/bin/sudo /usr/bin/gedit 等等,恢复csh.cshrc的原始版本,就可以解决问题了。
问题三:
linux的源没有gcc g++老版本(gcc 6 g++6,编译安装gamit所需)了,调用apt install时下载不到。
解决方法:参考这篇博文:https://www.cnblogs.com/leebri/p/16785774.html
提供的源链接可以下载更新:
deb http://dk.archive.ubuntu.com/ubuntu/ bionic main universe
问题四:
rmfresh command not found
make_gamit command not found
rmfresh make_gamit两个运行文件,明明在com那个文件夹下,但是就是在运行install_software时提示找不到命令。
见图:
此时需要把com链接到系统的环境目录下,我是参考这篇安装的博文得到的启发,感谢博主。
ubuntu20.04+GAMIT10.71安装_ubuntu20.04安装gamit-CSDN博客
解决方法:将以下语句在bash.bashrc(前面博主是在.bashrc, 我的系统中只找到bash.bashrc)中写入(直接打开文件编辑,或者vim,nano编辑都可),然后保存,重启系统。
export PATH="$PATH:/opt/source/gamit/bin:/opt/source/com:/opt/source/kf/bin"
export HELP_DIR=/opt/source/help/
问题五
sh_sp3fit开始显示ngstot getics error on sp file bad year 2021,作者仔细检查后发现是sp3文件名错了,21442周写成21142,可修改后依然报同样错误,头大!然后作者继续排查错误,按照师弟gamit解基线的实验报告把sestbl.文件做了修改,并通过软件的最新升级包对软件进行了升级后发现,问题解决了!
猜测可能错误原因,tables在更新时一些表文件没有更新或者根本没有,比如atml.grid(garner.ucsd.edu也没有这个文件)。导致在运行sh_setup时(基线解算的第一步,链接tables文件)有些文件没有链接上,通过升级软件后这些表文件得到补全,问题解决。