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原创 【clusterProfiler包】创建KEGG.db过程中的报错及解决办法

但是笔者还是推荐使用本地已经下载的KEGG.db数据,除了不易受到网络因素影响外,还可以避免因网络端更新造成的前后结果不一致,从而保证了数据的可重复性。在使用clusterProfiler包进行enrichKEGG()分析时,默认使用KEGG在线最新数据进行分析(use_internal_data = FALSE)。④安装KEGG.db包(KEGG.db_1.0.tar.gz文件一般创建在当前工作目录,手动安装也可)这种情况是由于KEGG链接原因导致的,具体解决办法建议参考生信~鱼同学的文章!

2023-03-19 11:21:36 7442 6

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