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原创 HiC-Pro安装
可以发现在此环境中配置了python=3.8.10 scipy numpy iced bx-python pysam cooler。如果是手动下载依赖环境,则需要指定依赖环境的路径,配置config-install.txt。将下载好的.sra数据用fastq-dump转换成fastq或fastq.gz保存在。但是逐个去安装依赖环境非常复杂,因此官网提供了yml文件,便于配置环境。根据HiC-pro Github官网指南,我们可以知道需要以下依赖。使用which命令查找路径。
2023-09-18 16:11:55
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