高校科研算力需求分析,助力打造高性能科学计算平台

高校作为基础研究的主阵地,正扛起推进AI研发和应用的大旗,如何构建AI所需的超高算力并加速科研成果转化早已提上日程。高性能计算系统正是利用高算力集群解决复杂度高、计算量大的科学问题,有助于科学研究人员借助AI计算更高效地完成科研工作。

 

 

科研中HPC应用现状

 

在不同科研场景下,包含能源勘探、CAD仿真、基因测序、气象预测等专业软件,用户对HPC(高性能计算)的需求各不相同,大致可从五个维度来量化分析:浮点运算、内存带宽、网络带宽、网络时延、IO性能(高速读/写带宽)。

 

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▲ HPC主要科研领域及常见应用

 

目前,AI和数据科学正在成为科学发现新的重要组成部分。人们借助深度学习,大幅提升了数据科学的准确性和响应时间,从而能够对海量数据做出前所未有的深度研究。

 

 

同时随着登纳德缩放定律已达到其极限,单线程性能受到制约。GPU凭借在浮点运算、并行计算等部分计算方面,可以提供数十倍乃至于上百倍于CPU的性能,已成为构建算力集群的主流解决方案。截止到2018年,超过580个HPC应用可以经过GPU加速。

 

▲ 50个最常用的高性能计算(HPC)应用程序

 

国内实例:交大科学计算平台

 

去年11月,上海交通大学AI计算平台正式开放,峰值算力达16PFLOPS,面向上海交通大学各院系和科研机构提供高效的算力支撑。

 

▲ 上海交通大学计算中心机房

 

上海交大AI计算平台作为校级高性能计算公共服务平台,已支持理、工、生、医的多篇研究发表于《Science》、《Nature》等高水平期刊上。上海交大人工智能研究院、Bio-X研究院、密西根联合学院等多院系的研究团队在计算中心的帮助下优化计算AI及HPC应用,最高将科研效率提升1.8万倍。

 

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专业构筑高性能计算平台

“芯”力无穷尽享科研加速

 

宽泛科技作为英特尔、英伟达等芯片及品牌厂商的坚实合作伙伴,NVIDIA潜力AI公司加速计划成员,携手专注为人工智能提供硬件解决方案及相关服务,已成为国内过万家企业、院校及研究机构的信息化解决方案供应商。

 

 

旗下品牌Cloudhin云轩专业工程师可为您量身定制深度学习AI服务器/工作站,适合基于深度学习技术实现的各种AI+行业场景的AI加速推理。

 

 

Cloudhin®云轩GS4288-P4采用Intel C612最高速芯片组,支持双E5-2600 v4/v3处理器,性能稳定,把握十足。最高可搭载8个NVIDIA图形处理器,NVIDIA RTX 2080/S/Ti、NVIDIA RTX TiTAN、TESLA T4/P100/V100,均支持按需定制。轻松应对分子动力学模拟、排序,生命科学与医疗分析、石油天然气勘探、GPU虚拟化,是复杂模型计算的理想选择。

 

 

专业勤修,锐意进取。云轩技术工程师毕业于NVIDIA深度学习研究所,丰富经验,值得信赖。更多定制方案请联系客服,我们将实时响应您的定制需求。

 

联系我们

如果您有合作需求或宝贵建议,欢迎来信。

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合作热线:021-5415 5559

 

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1 某某汽车高性能计算管理平台系统需求 5 1.1 业务需求分析: 5 2 某某汽车 HPC/CAE云计算中心建设目标、策略及步骤 7 3.1 建设目标与策略 7 3.2 建设步骤 8 3 面向高性能计算中心的资源管理、作业调度系统方案 10 3.1 基于应用的场景分析 10 3.1.1 终端用户通过Compute Manager,提交Fluent批处理计算作业 10 3.1.2 终端用户通过Display Manager,提交需要图形节点支持的图形交互程序 13 3.1.3 终端用户通过Compute Manager,在线查看CAE计算结果中的动画 14 3.1.4 终端用户通过Portal启动其他第三方的虚拟桌面,如Ctrix 15 3.2 某某汽车技术中心 HPC云计算平台管理场景 17 3.2.1 HPC云计算平台管理维护 17 3.2.2 HPC云计算平台软、硬件利用情况监控、统计分析 18 4 澳汰尔PBS Works产品介绍 20 4.1 系统逻辑图 20 4.2 系统物理架构图 22 4.4 PBS Professional产品介绍 25 4.4.1 整合计算资源、方便用户使用 25 4.4.2 可靠性、可用性、可维护性(RAS) 26 4.4.3 贯彻企业服务公约管理模式 29 4.4.4 优化计算资源的使用 29 4.4.5 计算资源管理功能 30 4.4.6 作业调度功能 32 4.4.7 Hooks功能 34 4.4.8 网格计算 35 4.4.9 安全认证 35 4.5 PAS(PBS 应用服务) 37 4.6 Compute Manager 40 4.6.1 三员管理 41 4.7 Display Manager 42 4.7.1 Display Manager系统架构 44 4.7.2 Display Manager使用体验 45 4.8 PBS Works定制功能 48 4.8.1 菜单布局:通常将布局分为三个模块:计算管理器、集群状态、管理员工具。如果有其他的模块,我们可以方便地集成在这个框架内(awpf)。菜单模块支持用户访问控制。 48 4.8.2 集群状态监控:统计所有计算节点的运行状态、节点类型、应用程序、物理内存、实际使用内存、内存使用率、节点利用率等信息。磁盘信息和实际CPU利用率,通过数字的颜色来反应使用程度:0%<X<30%(绿色),30%<X<50%(蓝色),50%<X<80%(橙色),80%<X>在线设置或修改节点上绑定的applications 50 4.8.5 管理员工具>>用户统计:用户名称,作业总数,运行作业个数,排队作业个数,申请cpu核数,使用cpu核数,排队cpu核数等信息。申请cpu总资源比,通过数字的颜色来反应使用程度:0%<X<30%(绿色),30%<X<50%(蓝色),50%<X<80%(橙色),80%<X>作业管理:统计作业号、作业名称、用户、软件、节点数、核数、状态、开始时间、优先级等信息。当作业排队状态时,允许修改作业的优先级。另外管理员也可以删除任意作业。 51 4.8.7 管理员工具>>监控作业排队原因 51 4.8.8 管理员工具>>一周作业统计: 统计当天到过去一周内所累积的运行和排队作业个数。 51 4.8.9 管理员工具>>求解器使用情况统计:统计每个求解器提交的作业总数,在运行的作业,请求的cpu,排队cpu,使用cpu等信息。 52 4.8.10 管理员工具>>磁盘统计:通过WEB页面随时了解本地磁盘的使用情况。使用百分率,通过数字的颜色来反应使用程度:0%<X<30%(绿色),30%<X<50%(蓝色),50%<X<80%(橙色),80%<X>项目管理项:管理员可以以项目为单位,设定项目编号、项目名称、项目的开始和结束时间,项目组人员和项目的优先级。当有紧急的项目,管理员可以把项目的优先级提高,并可以把相应的用户加到项目组中,以此提高项目组成员的作业优先级。用户在Web Portal页面提交作业可以选择项目名称,并且只能选择自己所属项目的项目名称。 53 4.8.12 管理员工具>>作业委托管理: 统计当前用户自己所提交的作业总数,包含:作业号,作业名称,具体用户,使用的软件,使用节点数,作业状态等信息,用户可以把自己的一部分作业或所有作业委托给其他用户. 53 4.8.13 管理员工具>> CPU资源份额调整: 统计所有队列下每个用户的软份额限制,硬份额限制(软限制>整体HPC计算资源实时使用统计: 统计当前所有高性能机器集群的计算资源数目,运行状况,存储等使用情况。 54 4.8.15 管理员工具>> WEB版FTP大文件上传: 招标书中明确要求提供基于网页版的FTP上传工具,方便上传大文件。 55 4.8.16 portal用户密码校验: 为了安全保密,当用户在登陆portal的时候,连续5此输入密码错误,系统会冻结用户。直到一段时间后,方可再次登陆。 55 4.9 报表工具PBS Analytics介绍 56 4.9.1 Analytics架构 56 4.9.2 Analytics功能说明 57 4.9.3 Analytics实际案例分析 57 4.10 SAO解决方案 59 4.10.1 SAO架构 60 5 PBS支持仿真软件 61 5.1 CAE领域中支持软件分类及特点 61 5.2 CAE领域中支持软件及介绍 61 5.3 CFD领域中支持软件及介绍 63 5.4 其他领域及自研软件 64 6 和其他作业调度系统的比较优势 65 6.1 Top100超级计算中心占有率对比 65 6.2 Display Manager让用户的仿真整个过程从工作站到了云端 65 6.3 针对大规模计算中心之功能特性 67 6.4 领域知识对比(并有能帮助HPC中心建立围绕计算的业务能) 68 7 成功案例 68 7.1 汽车行业用户列表 68 7.2 成功案例-泛亚汽车(通用设计中心) 69 7.3 PBS在中国实施的大规模计算案例 71 7.4 PBS在全球实施的大规模计算案例 72 8 平台架构与软硬件配置建议 72 8.1 硬件平台选型常见误区 72 8.2 cpu架构的选择 73 8.3 计算网络的选择 76 8.4 存储系统的选择 79 8.5 GPU的选择 80 8.6 节点类型的选择 87 8.7 操作系统的选择 87 8.8 并行文件系统的选择 88 8.9 PBS Professional的数据流控制 89 8.10 推荐配置 90 9 硬件常见测试 92 9.1 性能峰值能测试点 92 9.2 测试压 92 9.2.1 估结果 92 9.2.1.1. 性能峰值能测试估 92 9.3 测试完成准则 93 9.4 测试风险 93 9.5 测试策略 93 9.6 测试用例详细 93 9.6.1 术语 93 9.6.2 性能测试用例描述 94 9.6.2.1. 机群性能测试描述 94 10 Altair介绍 96

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